166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2551 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2551  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1943  30S ribosomal protein S21  89.23 
 
 		 65 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2124  30S ribosomal protein S21  90.77 
 
 		 65 aa  117  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.487  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2176  30S ribosomal protein S21  89.23 
 
 		 65 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0283  30S ribosomal protein S21  95.38 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2278  30S ribosomal protein S21  96.92 
 
 		 65 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.166233  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1632  30S ribosomal protein S21  93.85 
 
 		 65 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0097  ribosomal protein S21  58.14 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  51.92 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3397  30S ribosomal protein S21  58.14 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.616892  normal  0.237607 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0829  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.877836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2369  ribosomal protein S21  34.43 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.688935  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0839  ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1933  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  44.83 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0385  30S ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  40 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  41.82 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  46.51 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0129  ribosomal protein S21  41.38 
 
 		 58 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000000381308  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1303  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000518978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0984  30S ribosomal protein S21  39.66 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624042  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00075  ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  37.93 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  33.9 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  33.9 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  36.51 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3215  ribosomal protein S21  41.86 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603816  hitchhiker  0.00000000377258 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  33.9 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 58 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1330  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0262  30S ribosomal protein S21  36.84 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0918517  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2473  30S ribosomal protein S21  39.53 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000983176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0896  30S ribosomal protein S21  36.36 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.82181  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0389  30S ribosomal protein S21  36.36 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  38.98 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1947  30S ribosomal protein S21  36.36 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1856  30S ribosomal protein S21  36.36 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  33.85 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0389  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0205  ribosomal protein S21  31.03 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  39.68 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000175133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  40.91 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  32.73 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  32.73 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  32.73 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  30.91 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4026  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  42.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0423  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4813  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.32458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0420  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0313754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  38.64 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1001  30S ribosomal protein S21  34.09 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  45.24 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  30.91 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0974  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07560  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.146275 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1056  ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0630  ribosomal protein S21  45.24 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.134333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0722  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46980  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  38.18 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 77 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  30.16 
 
 		 70 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  33.33 
 
 		 70 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1041  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000208407  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  34.55 
 
 		 66 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  32.76 
 
 		 71 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  32.73 
 
 		 70 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0728  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 63 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000434468  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  36 
 
 		 71 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0314  ribosomal protein S21  39.58 
 
 		 64 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1075  30S ribosomal protein S21  39.53 
 
 		 71 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.015227  normal  0.70194 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1156  30S ribosomal protein S21  39.53 
 
 		 71 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000152947  normal  0.0305894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  30.91 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  38.18 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  30.91 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>