More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1330 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1330  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
56 aa  110  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0129  ribosomal protein S21  58.93 
 
 
58 aa  73.9  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000000381308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  60.71 
 
 
59 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 
58 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  57.14 
 
 
59 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 
58 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
57 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3215  ribosomal protein S21  62.5 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603816  hitchhiker  0.00000000377258 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  58.93 
 
 
60 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 
58 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  53.7 
 
 
58 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
58 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  58.33 
 
 
57 aa  63.9  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  54.55 
 
 
60 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 
57 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  50 
 
 
61 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
58 aa  62  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1918  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 
58 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4447  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 
58 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657819  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1573  30S ribosomal protein S21  71.05 
 
 
58 aa  60.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000232116  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 
70 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  48.21 
 
 
58 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  48.21 
 
 
58 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  54 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1056  ribosomal protein S21  59.52 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2872  30S ribosomal protein S21  46 
 
 
60 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.731741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1344  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 
59 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3249  30S ribosomal protein S21  46 
 
 
60 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  47.27 
 
 
70 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  46.43 
 
 
71 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  46.43 
 
 
71 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  57  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  57  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
70 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2363  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929695  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  41.82 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4643  30S ribosomal protein S21  44.9 
 
 
62 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0890115  normal  0.0585031 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
71 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4602  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 
62 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849069  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1119  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 
61 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 
71 aa  54.3  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
70 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  43.64 
 
 
71 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 
71 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  50 
 
 
58 aa  54.3  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10661  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 
58 aa  53.9  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0993  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 
58 aa  53.9  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.149437  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3780  30S ribosomal protein S21  40 
 
 
70 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792875  normal  0.0326962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3254  30S ribosomal protein S21  40 
 
 
70 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0163212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>