231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3927 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  100 
 
 		 64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0097  ribosomal protein S21  72.13 
 
 		 65 aa  99.4  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1933  30S ribosomal protein S21  61.9 
 
 		 64 aa  80.1  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0839  ribosomal protein S21  66.07 
 
 		 64 aa  80.1  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00075  ribosomal protein S21  60.94 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0829  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.877836  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0385  30S ribosomal protein S21  57.41 
 
 		 63 aa  72  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3397  30S ribosomal protein S21  61.4 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.616892  normal  0.237607 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  46.88 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2551  30S ribosomal protein S21  55.32 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2124  30S ribosomal protein S21  51.92 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.487  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1632  30S ribosomal protein S21  51.06 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2278  30S ribosomal protein S21  53.19 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.166233  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5595  30S ribosomal protein S21  45.61 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5959  30S ribosomal protein S21  45.61 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6460  30S ribosomal protein S21  45.61 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0283  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1943  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2176  30S ribosomal protein S21  48.08 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5585  30S ribosomal protein S21  42.11 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5802  30S ribosomal protein S21  42.11 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1697  ribosomal protein S21  63.16 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.674654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5375  ribosomal protein S21  50 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.55538 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  47.83 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0896  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.82181  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0389  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  47.83 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  47.83 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1947  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1856  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0797  ribosomal protein S21  42.11 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.914511  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1001  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1020  30S ribosomal protein S21  51.22 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  51.22 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0728  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000434468  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  51.22 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3780  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792875  normal  0.0326962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3254  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0163212 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  47.83 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 58 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0811  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0924  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0294351  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  46.51 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  47.83 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  40.38 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  47.83 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  41.51 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  40.38 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  41.3 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1075  30S ribosomal protein S21  45.24 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.015227  normal  0.70194 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1156  30S ribosomal protein S21  45.24 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000152947  normal  0.0305894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  39.13 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  46.34 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  37.74 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  37.74 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  37.74 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  46.34 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1667  30S ribosomal protein S21  46.34 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1044  ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0544363  normal  0.843501 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  41.3 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>