32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1697 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1697  ribosomal protein S21  100 
 
 		 64 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.674654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0097  ribosomal protein S21  67.24 
 
 		 65 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  59.38 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0839  ribosomal protein S21  58.62 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0829  30S ribosomal protein S21  60.34 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.877836  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00075  ribosomal protein S21  58.62 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1933  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  48.44 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0385  30S ribosomal protein S21  48.28 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3397  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.616892  normal  0.237607 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2176  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2551  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2124  30S ribosomal protein S21  47.83 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.487  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2278  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.166233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0283  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  44.23 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1632  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1943  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0314  ribosomal protein S21  36.96 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555327 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  44.19 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2461  ribosomal protein S21  48.65 
 
 		 60 aa  40.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0201196  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5802  30S ribosomal protein S21  31.75 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5585  30S ribosomal protein S21  31.75 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5595  30S ribosomal protein S21  33.33 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5959  30S ribosomal protein S21  33.33 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6460  30S ribosomal protein S21  33.33 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>