240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0839 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0839  ribosomal protein S21  100 
 
 		 64 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0097  ribosomal protein S21  70.69 
 
 		 65 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  66.07 
 
 		 64 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0385  30S ribosomal protein S21  56.67 
 
 		 63 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3397  30S ribosomal protein S21  64.41 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.616892  normal  0.237607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00075  ribosomal protein S21  56.9 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0829  30S ribosomal protein S21  58.62 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.877836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1933  30S ribosomal protein S21  54.24 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  46.03 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5595  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5959  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0797  ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.914511  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5802  30S ribosomal protein S21  40.68 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5585  30S ribosomal protein S21  40.68 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  55.81 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  55.81 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6460  30S ribosomal protein S21  40.68 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  55.81 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  55.81 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2124  30S ribosomal protein S21  54.35 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.487  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5375  ribosomal protein S21  50 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.55538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 58 aa  50.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2551  30S ribosomal protein S21  52.17 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0314  ribosomal protein S21  40.38 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555327 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  45.83 
 
 		 71 aa  50.1  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2278  30S ribosomal protein S21  52.17 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.166233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1632  30S ribosomal protein S21  47.83 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  47.37 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  47.37 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0283  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  48.08 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  35.94 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1697  ribosomal protein S21  58.62 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.674654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  41.51 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1044  ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0544363  normal  0.843501 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1943  30S ribosomal protein S21  47.83 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1075  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.015227  normal  0.70194 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1156  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000152947  normal  0.0305894 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2176  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  48.08 
 
 		 58 aa  47.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4337  30S ribosomal protein S21  45.24 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  41.54 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0423  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  45.61 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  41.54 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46980  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2987  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  41.54 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  41.54 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>