225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3397 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3397  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 65 aa  127  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.616892  normal  0.237607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0097  ribosomal protein S21  60.34 
 
 		 65 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0839  ribosomal protein S21  64.41 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  61.4 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  48.44 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0385  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0829  30S ribosomal protein S21  51.85 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.877836  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00075  ribosomal protein S21  50 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1933  30S ribosomal protein S21  45.9 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  59.52 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5595  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5959  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2124  30S ribosomal protein S21  46.88 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.487  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2551  30S ribosomal protein S21  56.52 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  46.88 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  54.76 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0797  ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.914511  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6460  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  55.81 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  54.76 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0999  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000187579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1288  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1107  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000130678  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3166  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000179646  normal  0.223095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1191  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000011604  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1632  30S ribosomal protein S21  54.35 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2831  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000453296  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0961  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000165734  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2905  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000815999  normal  0.0381959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2987  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000114184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2993  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0342292  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3084  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000168191  hitchhiker  0.000271061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2278  30S ribosomal protein S21  54.35 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.166233  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1224  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000866811  normal  0.520215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1147  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000110786  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5375  ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.55538 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5585  30S ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  54.76 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5802  30S ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0826  30S ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0389  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4026  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1075  30S ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.015227  normal  0.70194 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0420  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0313754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  53.49 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1156  30S ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000152947  normal  0.0305894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4813  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.32458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  51.02 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  53.49 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0423  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>