192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00075 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00075  ribosomal protein S21  100 
 
 		 81 aa  166  7e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0829  30S ribosomal protein S21  76.19 
 
 		 64 aa  103  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.877836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1933  30S ribosomal protein S21  78.33 
 
 		 64 aa  100  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0385  30S ribosomal protein S21  61.9 
 
 		 63 aa  87  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0097  ribosomal protein S21  68.52 
 
 		 65 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  60.94 
 
 		 64 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0839  ribosomal protein S21  56.9 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  49.21 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3397  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.616892  normal  0.237607 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0314  ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555327 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2124  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.487  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  47.83 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  46.51 
 
 		 93 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  39.68 
 
 		 69 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  44.23 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  44.07 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  44.07 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2278  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.166233  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0262  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0918517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1697  ribosomal protein S21  58.62 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.674654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1020  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  43.48 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  48.94 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  46.81 
 
 		 58 aa  47.4  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 58 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5375  ribosomal protein S21  47.83 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.55538 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0283  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2551  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1943  30S ribosomal protein S21  41.86 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2473  30S ribosomal protein S21  40.91 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000983176  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1632  30S ribosomal protein S21  41.3 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  40.38 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  40.38 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1303  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000518978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2176  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  37.74 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0984  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624042  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1044  ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0544363  normal  0.843501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4337  30S ribosomal protein S21  45.24 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03454  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5585  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1041  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000208407  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5802  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6460  30S ribosomal protein S21  44.07 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  36.54 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  40.38 
 
 		 58 aa  43.5  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0660  30S ribosomal protein S21  45.24 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  39.53 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4390  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.994986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4208  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4046  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4056  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.156818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4427  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150613  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0416  ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4534  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  40.38 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0974  30S ribosomal protein S21  45.24 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5595  30S ribosomal protein S21  47.83 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0808  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.010584  decreased coverage  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4160  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5959  30S ribosomal protein S21  47.83 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  41.86 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4442  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000763687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>