250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0141 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
64 aa  125  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0097  ribosomal protein S21  51.72 
 
 
65 aa  67  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3397  30S ribosomal protein S21  48.44 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.616892  normal  0.237607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  46.88 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00075  ribosomal protein S21  49.21 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0829  30S ribosomal protein S21  47.54 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.877836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0839  ribosomal protein S21  46.03 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_002950  PG0385  30S ribosomal protein S21  49.15 
 
 
63 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1632  30S ribosomal protein S21  54.35 
 
 
65 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2124  30S ribosomal protein S21  54.35 
 
 
65 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2551  30S ribosomal protein S21  52.17 
 
 
65 aa  53.9  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1943  30S ribosomal protein S21  46.03 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 
70 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 
70 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2278  30S ribosomal protein S21  52.17 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.166233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1933  30S ribosomal protein S21  38.98 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0283  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 
65 aa  52  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  36.84 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2369  ribosomal protein S21  44.23 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.688935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  36.84 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 
70 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5585  30S ribosomal protein S21  38.98 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  36.84 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5595  30S ribosomal protein S21  37.29 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5802  30S ribosomal protein S21  38.98 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5959  30S ribosomal protein S21  37.29 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2176  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  45.61 
 
 
71 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  45.61 
 
 
71 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  45.61 
 
 
71 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
70 aa  50.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
70 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
70 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
70 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  50 
 
 
58 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  50 
 
 
58 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  44.23 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2093  ribosomal protein S21  42.62 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.320771  normal  0.211953 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 
71 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2363  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929695  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  38.6 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  35.09 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3780  30S ribosomal protein S21  38.6 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792875  normal  0.0326962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  38.6 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3254  30S ribosomal protein S21  38.6 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0163212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1697  ribosomal protein S21  50 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.674654  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6460  30S ribosomal protein S21  35.59 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  38.6 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  38.6 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  38.6 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  41.38 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  40 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  41.3 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  46.51 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  40 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  55.56 
 
 
57 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  41.07 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  51.92 
 
 
57 aa  48.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>