More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1995 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
58 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
58 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  86.21 
 
 
58 aa  100  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  82.76 
 
 
58 aa  98.6  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  82.76 
 
 
61 aa  98.2  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  84.48 
 
 
58 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  81.03 
 
 
58 aa  94.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 
58 aa  89.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  76.79 
 
 
59 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  75 
 
 
59 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  71.93 
 
 
58 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  70.91 
 
 
60 aa  84.3  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  74.14 
 
 
58 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  74.14 
 
 
58 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1667  30S ribosomal protein S21  74.14 
 
 
58 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  68.97 
 
 
65 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  65.52 
 
 
65 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  73.21 
 
 
58 aa  81.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  73.21 
 
 
58 aa  82  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4331  30S ribosomal protein S21  73.68 
 
 
57 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7009999999999997e-53 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4427  30S ribosomal protein S21  73.68 
 
 
57 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4390  30S ribosomal protein S21  73.68 
 
 
57 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.994986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4442  30S ribosomal protein S21  73.68 
 
 
57 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000763687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4208  30S ribosomal protein S21  73.68 
 
 
57 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4046  30S ribosomal protein S21  73.68 
 
 
57 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4056  30S ribosomal protein S21  73.68 
 
 
57 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.156818  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3035  30S ribosomal protein S21  73.68 
 
 
57 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00632244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4160  30S ribosomal protein S21  73.68 
 
 
57 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4534  30S ribosomal protein S21  73.68 
 
 
57 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0808  30S ribosomal protein S21  73.68 
 
 
57 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.010584  decreased coverage  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  67.86 
 
 
60 aa  80.9  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  65.52 
 
 
65 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3215  ribosomal protein S21  74 
 
 
65 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603816  hitchhiker  0.00000000377258 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  68.42 
 
 
57 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0129  ribosomal protein S21  64.29 
 
 
58 aa  76.6  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000000381308  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1429  30S ribosomal protein S21  71.43 
 
 
58 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000209576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  63.64 
 
 
57 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1020  30S ribosomal protein S21  69.64 
 
 
57 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  60.34 
 
 
71 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  61.11 
 
 
58 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  60.71 
 
 
57 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  62.07 
 
 
71 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  67.86 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  65.31 
 
 
57 aa  71.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  63.79 
 
 
71 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  60.34 
 
 
77 aa  70.5  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  58.62 
 
 
71 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  67.44 
 
 
64 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  67.44 
 
 
93 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  67.44 
 
 
64 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  58.62 
 
 
71 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  67.44 
 
 
64 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  58.62 
 
 
71 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0728  30S ribosomal protein S21  69.23 
 
 
63 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000434468  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  58.62 
 
 
71 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  60.34 
 
 
71 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  61.82 
 
 
71 aa  68.6  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  58.62 
 
 
71 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  61.82 
 
 
71 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  58.62 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  58.62 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  61.82 
 
 
71 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  61.82 
 
 
71 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0984  30S ribosomal protein S21  65.45 
 
 
64 aa  68.2  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624042  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  61.82 
 
 
71 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  61.82 
 
 
71 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  53.45 
 
 
70 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
70 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
71 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  51.72 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  58.62 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  56.36 
 
 
71 aa  67.4  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  60 
 
 
71 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
71 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 
70 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1303  30S ribosomal protein S21  61.82 
 
 
61 aa  67  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000518978  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  58.62 
 
 
70 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 
70 aa  66.6  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  56.9 
 
 
70 aa  66.6  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
70 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 
70 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 
70 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
70 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  53.45 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  53.45 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
71 aa  65.9  0.0000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2363  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929695  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0660  30S ribosomal protein S21  69.05 
 
 
71 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186503  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
71 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>