289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1098 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 71 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  90.14 
 
 		 71 aa  123  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  110  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  77.46 
 
 		 71 aa  110  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  77.46 
 
 		 71 aa  110  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  77.46 
 
 		 71 aa  110  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  73.24 
 
 		 71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  77.78 
 
 		 77 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  73.24 
 
 		 71 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  70.42 
 
 		 71 aa  103  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  70.42 
 
 		 71 aa  103  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  73.24 
 
 		 71 aa  103  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  103  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  73.24 
 
 		 71 aa  103  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  73.24 
 
 		 71 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  70.42 
 
 		 71 aa  100  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  66.2 
 
 		 71 aa  100  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  69.01 
 
 		 71 aa  100  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  70.42 
 
 		 71 aa  100  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000175133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  68.66 
 
 		 79 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  68.66 
 
 		 79 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0389  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4026  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0423  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4813  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.32458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0420  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0313754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0660  30S ribosomal protein S21  78.87 
 
 		 71 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  67.19 
 
 		 70 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  71.88 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1781  30S ribosomal protein S21  60.87 
 
 		 74 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.966323  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0974  30S ribosomal protein S21  78.87 
 
 		 71 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0396  30S ribosomal protein S21  60.87 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0826  30S ribosomal protein S21  73.24 
 
 		 71 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 		 70 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  68.33 
 
 		 70 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3166  30S ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000179646  normal  0.223095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1191  30S ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000011604  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  71.67 
 
 		 70 aa  87.8  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1288  30S ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  88.2  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1107  30S ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  88.2  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000130678  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1224  30S ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000866811  normal  0.520215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0961  30S ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  88.2  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000165734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2831  30S ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  88.2  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000453296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1147  30S ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000110786  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2905  30S ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000815999  normal  0.0381959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2987  30S ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000114184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2993  30S ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  88.2  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0342292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0999  30S ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000187579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3084  30S ribosomal protein S21  71.83 
 
 		 71 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000168191  hitchhiker  0.000271061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1156  30S ribosomal protein S21  70.42 
 
 		 71 aa  87.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000152947  normal  0.0305894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3780  30S ribosomal protein S21  68.33 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792875  normal  0.0326962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3254  30S ribosomal protein S21  68.33 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0163212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1075  30S ribosomal protein S21  69.01 
 
 		 71 aa  87.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.015227  normal  0.70194 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  65.62 
 
 		 70 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  65.62 
 
 		 70 aa  87  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0042  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 71 aa  87  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0926773  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  64.06 
 
 		 70 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  64.06 
 
 		 70 aa  86.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03454  30S ribosomal protein S21  77.46 
 
 		 71 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000193859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>