181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2369 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2369  ribosomal protein S21  100 
 
 		 67 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.688935  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2124  30S ribosomal protein S21  35.48 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.487  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  53.7 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  44.23 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1943  30S ribosomal protein S21  34.43 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0728  30S ribosomal protein S21  51.06 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000434468  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2176  30S ribosomal protein S21  34.43 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1303  30S ribosomal protein S21  46.81 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000518978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  40.38 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  40.38 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1632  30S ribosomal protein S21  39.13 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  40.38 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0984  30S ribosomal protein S21  43.86 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624042  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0283  30S ribosomal protein S21  41.46 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1208  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  47.73 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0205  ribosomal protein S21  39.22 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  47.73 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  43.86 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1020  30S ribosomal protein S21  48.21 
 
 		 57 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  50.88 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2551  30S ribosomal protein S21  36.96 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  41.94 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000175133  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3166  30S ribosomal protein S21  56.41 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000179646  normal  0.223095 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1288  30S ribosomal protein S21  56.41 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  56.1 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2831  30S ribosomal protein S21  56.41 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000453296  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2905  30S ribosomal protein S21  56.41 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000815999  normal  0.0381959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2987  30S ribosomal protein S21  56.41 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000114184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2993  30S ribosomal protein S21  56.41 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0342292  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3084  30S ribosomal protein S21  56.41 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000168191  hitchhiker  0.000271061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2278  30S ribosomal protein S21  36.96 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.166233  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1147  30S ribosomal protein S21  56.41 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000110786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0999  30S ribosomal protein S21  56.41 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000187579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1107  30S ribosomal protein S21  56.41 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000130678  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1224  30S ribosomal protein S21  56.41 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000866811  normal  0.520215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1191  30S ribosomal protein S21  56.41 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000011604  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0961  30S ribosomal protein S21  56.41 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000165734  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0389  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2093  ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.320771  normal  0.211953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3249  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  46.94 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07560  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.146275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0420  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0313754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46980  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0826  30S ribosomal protein S21  53.85 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4813  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.32458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4026  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0423  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2872  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.731741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0722  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1156  30S ribosomal protein S21  53.85 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000152947  normal  0.0305894 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  41.38 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  40.32 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03454  30S ribosomal protein S21  48.78 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1075  30S ribosomal protein S21  53.85 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.015227  normal  0.70194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3215  ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603816  hitchhiker  0.00000000377258 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>