262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1303 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1303  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
61 aa  119  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000518978  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0984  30S ribosomal protein S21  81.97 
 
 
64 aa  102  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  80 
 
 
69 aa  90.1  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0728  30S ribosomal protein S21  82.69 
 
 
63 aa  89.4  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000434468  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  78.95 
 
 
58 aa  87.8  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1020  30S ribosomal protein S21  80 
 
 
57 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  80 
 
 
57 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1429  30S ribosomal protein S21  77.19 
 
 
58 aa  86.7  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000209576  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  77.19 
 
 
58 aa  85.9  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  76.36 
 
 
58 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1667  30S ribosomal protein S21  76.36 
 
 
58 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  76.36 
 
 
58 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3035  30S ribosomal protein S21  78.18 
 
 
57 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00632244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4331  30S ribosomal protein S21  76.36 
 
 
57 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7009999999999997e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4390  30S ribosomal protein S21  76.36 
 
 
57 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.994986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4208  30S ribosomal protein S21  76.36 
 
 
57 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4046  30S ribosomal protein S21  76.36 
 
 
57 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4056  30S ribosomal protein S21  76.36 
 
 
57 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.156818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0808  30S ribosomal protein S21  76.36 
 
 
57 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.010584  decreased coverage  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4534  30S ribosomal protein S21  76.36 
 
 
57 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4442  30S ribosomal protein S21  76.36 
 
 
57 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000763687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4427  30S ribosomal protein S21  76.36 
 
 
57 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4160  30S ribosomal protein S21  76.36 
 
 
57 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  69.09 
 
 
58 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  58.62 
 
 
60 aa  70.9  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  65.45 
 
 
58 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  67.27 
 
 
59 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  67.27 
 
 
61 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  61.82 
 
 
58 aa  67  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  61.82 
 
 
58 aa  67  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  65.45 
 
 
58 aa  67  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  63.64 
 
 
58 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  63.64 
 
 
58 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  51.72 
 
 
60 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  61.82 
 
 
59 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0129  ribosomal protein S21  63.64 
 
 
58 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000000381308  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
58 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3215  ribosomal protein S21  64 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603816  hitchhiker  0.00000000377258 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 
71 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  55.93 
 
 
71 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 
71 aa  61.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  54.24 
 
 
71 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  54.24 
 
 
71 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  55.93 
 
 
57 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  54.24 
 
 
71 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  50.85 
 
 
77 aa  57.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  54.24 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  52.54 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  49.18 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  53.33 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 
71 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  54.24 
 
 
71 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  52.46 
 
 
70 aa  57.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  54.24 
 
 
71 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  49.18 
 
 
70 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  50.82 
 
 
70 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  49.18 
 
 
70 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  50.82 
 
 
70 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  54.24 
 
 
71 aa  57  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  50.82 
 
 
70 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  52.46 
 
 
65 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  53.7 
 
 
58 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  50.82 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  52.54 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  55.36 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  55.36 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  50.82 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0314  ribosomal protein S21  52.83 
 
 
64 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  50.82 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  47.54 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  47.54 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  47.54 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  49.18 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  49.18 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>