192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1208 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1208  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
65 aa  125  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0984  30S ribosomal protein S21  40.62 
 
 
64 aa  56.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0129  ribosomal protein S21  50 
 
 
58 aa  53.9  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000000381308  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  47.37 
 
 
57 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  43.64 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  49.12 
 
 
58 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1303  30S ribosomal protein S21  40.98 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000518978  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
67 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
58 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1330  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 
56 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  43.86 
 
 
59 aa  50.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  43.75 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 
58 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 
79 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 
79 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  46.43 
 
 
57 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
58 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
58 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 
58 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1667  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 
58 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2473  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 
69 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000983176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  42.19 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  42.19 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  42.19 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2369  ribosomal protein S21  36.84 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.688935  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0350  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000144824  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_290  ribosomal protein S21  40.32 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000295675  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  40 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  40 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1344  30S ribosomal protein S21  45.61 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0329  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000310011  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  37.5 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  37.5 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 
58 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  37.5 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  41.27 
 
 
77 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 
58 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1056  ribosomal protein S21  54.76 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  41.94 
 
 
71 aa  47  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3215  ribosomal protein S21  43.48 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603816  hitchhiker  0.00000000377258 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  42.37 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  38.1 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4390  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.994986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4208  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4046  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4056  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.156818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0808  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.010584  decreased coverage  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  38.1 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4160  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4534  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  38.1 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1918  30S ribosomal protein S21  42.11 
 
 
58 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4427  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4602  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849069  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  40.62 
 
 
71 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  35.94 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4331  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7009999999999997e-53 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4442  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000763687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3035  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00632244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0314  ribosomal protein S21  43.75 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0262  30S ribosomal protein S21  41.94 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0918517  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3249  30S ribosomal protein S21  44 
 
 
60 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  36.51 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2872  30S ribosomal protein S21  44 
 
 
60 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.731741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  41.38 
 
 
57 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  40 
 
 
58 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4447  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 
58 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657819  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 
71 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0978  30S ribosomal protein S21  41.38 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0783666 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0951  30S ribosomal protein S21  41.38 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 
71 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  40 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>