280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3093 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 65 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  93.85 
 
 		 65 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  89.23 
 
 		 65 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0391  30S ribosomal protein S21  95.38 
 
 		 65 aa  94.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3793  30S ribosomal protein S21  92.31 
 
 		 65 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3698  30S ribosomal protein S21  92.31 
 
 		 65 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4051  30S ribosomal protein S21  92.31 
 
 		 65 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747096  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  68.25 
 
 		 66 aa  87  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  66.1 
 
 		 71 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  68.97 
 
 		 58 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  68.97 
 
 		 58 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  57.81 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  67.24 
 
 		 58 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  61.02 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  64.41 
 
 		 71 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  64.41 
 
 		 71 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  64.41 
 
 		 71 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  67.24 
 
 		 58 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  65.52 
 
 		 61 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  64.41 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  61.02 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  62.71 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  61.02 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  64.41 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  64.41 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  64.41 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  62.71 
 
 		 71 aa  77  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  62.71 
 
 		 71 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  79.07 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  62.71 
 
 		 71 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  65.52 
 
 		 58 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  79.07 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  79.07 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  79.07 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 71 aa  73.9  0.0000000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  73.6  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  61.02 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  61.02 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 71 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000175133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  60.34 
 
 		 58 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  61.02 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  60 
 
 		 58 aa  71.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  60 
 
 		 58 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  61.02 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0660  30S ribosomal protein S21  71.43 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186503  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  61.02 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  54.1 
 
 		 70 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1089  30S ribosomal protein S21  67.19 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  51.67 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  50.82 
 
 		 70 aa  67  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  56.36 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1974  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 		 71 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2340  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 		 71 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4026  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0389  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0423  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736721  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4337  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0420  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0313754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4813  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.32458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1781  30S ribosomal protein S21  51.61 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.966323  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0042  30S ribosomal protein S21  62.71 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0926773  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0722  30S ribosomal protein S21  64.41 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46980  30S ribosomal protein S21  64.41 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  57.41 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0974  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0396  30S ribosomal protein S21  51.61 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1044  ribosomal protein S21  64.29 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0544363  normal  0.843501 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07560  30S ribosomal protein S21  64.41 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.146275 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  60 
 
 		 58 aa  66.2  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  50.79 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 		 58 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>