293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1122 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 69 aa  140  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0728  30S ribosomal protein S21  88.46 
 
 		 63 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000434468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1020  30S ribosomal protein S21  82.46 
 
 		 57 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1429  30S ribosomal protein S21  77.59 
 
 		 58 aa  94.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000209576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  80.7 
 
 		 57 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  80.36 
 
 		 58 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  80.36 
 
 		 58 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1667  30S ribosomal protein S21  80.36 
 
 		 58 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  77.59 
 
 		 58 aa  91.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1303  30S ribosomal protein S21  80 
 
 		 61 aa  90.1  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000518978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3035  30S ribosomal protein S21  80.36 
 
 		 57 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00632244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0808  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 57 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.010584  decreased coverage  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4442  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 57 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000763687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4390  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 57 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.994986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4208  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 57 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4046  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 57 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4056  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 57 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.156818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4331  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 57 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7009999999999997e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4534  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 57 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4427  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 57 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4160  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 57 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  76.79 
 
 		 58 aa  87.4  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0984  30S ribosomal protein S21  76.36 
 
 		 64 aa  84  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  69.64 
 
 		 58 aa  77  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  69.64 
 
 		 58 aa  74.7  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 		 61 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  63.79 
 
 		 59 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  67.86 
 
 		 58 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  67.86 
 
 		 58 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  63.16 
 
 		 58 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  66.07 
 
 		 58 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 		 58 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  62.5 
 
 		 59 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  60 
 
 		 60 aa  67  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  60.71 
 
 		 58 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0129  ribosomal protein S21  58.93 
 
 		 58 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000000381308  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  57.41 
 
 		 58 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  57.14 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  54.39 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  55.36 
 
 		 57 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  56.36 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  62.5 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3215  ribosomal protein S21  62 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603816  hitchhiker  0.00000000377258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  58.18 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  52.63 
 
 		 70 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 57 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  56.36 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  56.36 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  56.6 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  56.6 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  56.6 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  56.6 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  56.6 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  56.6 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  56.6 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  52.63 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  56.6 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  56.36 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  59.62 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  56.6 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  53.45 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  50.88 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  56.6 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  50.88 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  56.6 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  56.6 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  53.45 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  50.88 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  50.88 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3780  30S ribosomal protein S21  54.72 
 
 		 70 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792875  normal  0.0326962 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3254  30S ribosomal protein S21  54.72 
 
 		 70 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0163212 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>