More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1989 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  100 
 
 
60 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  72.41 
 
 
58 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  71.43 
 
 
58 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  69.64 
 
 
58 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  66.1 
 
 
60 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  67.86 
 
 
58 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  67.86 
 
 
58 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  66.67 
 
 
59 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  65 
 
 
61 aa  76.6  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 
58 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 
58 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  63.16 
 
 
57 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  60.71 
 
 
58 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  62.96 
 
 
58 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  60.71 
 
 
59 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  59.65 
 
 
58 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  62.96 
 
 
65 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  61.82 
 
 
57 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  57.89 
 
 
58 aa  70.9  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  62.5 
 
 
57 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1303  30S ribosomal protein S21  58.62 
 
 
61 aa  70.9  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000518978  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0129  ribosomal protein S21  62.07 
 
 
58 aa  70.5  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000000381308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1020  30S ribosomal protein S21  62.5 
 
 
57 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0984  30S ribosomal protein S21  60.34 
 
 
64 aa  70.1  0.000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3215  ribosomal protein S21  64 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603816  hitchhiker  0.00000000377258 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4390  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 
57 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.994986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4208  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 
57 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4046  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 
57 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4056  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 
57 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.156818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4427  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 
57 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4442  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 
57 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000763687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4160  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 
57 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0808  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 
57 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.010584  decreased coverage  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4534  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 
57 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  63.27 
 
 
57 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4331  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 
57 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7009999999999997e-53 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3035  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 
57 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00632244  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 
58 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1667  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 
58 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 
58 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0728  30S ribosomal protein S21  63.46 
 
 
63 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000434468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  57.41 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1429  30S ribosomal protein S21  56.14 
 
 
58 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000209576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1918  30S ribosomal protein S21  56.14 
 
 
58 aa  64.7  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4447  30S ribosomal protein S21  56.14 
 
 
58 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657819  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  53.7 
 
 
65 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1330  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 
56 aa  62.8  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233824  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  52.73 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  59.62 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  57.69 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  53.85 
 
 
70 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  55.77 
 
 
71 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  58.14 
 
 
93 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  56.67 
 
 
71 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  56.67 
 
 
71 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  57.69 
 
 
71 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  57.69 
 
 
71 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  57.69 
 
 
71 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  58.14 
 
 
64 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1344  30S ribosomal protein S21  50.88 
 
 
59 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  58.14 
 
 
64 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  58.14 
 
 
64 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  55.77 
 
 
71 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  55.77 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  51.92 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  53.57 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1056  ribosomal protein S21  60.47 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  55.77 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  50 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0978  30S ribosomal protein S21  45 
 
 
61 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0783666 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4602  30S ribosomal protein S21  46.55 
 
 
62 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849069  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0951  30S ribosomal protein S21  45 
 
 
61 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>