289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0755 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  100 
 
 
93 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
64 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
64 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  79.03 
 
 
65 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  75.81 
 
 
65 aa  97.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  77.42 
 
 
65 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
64 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  67.24 
 
 
58 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  67.24 
 
 
58 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  64.52 
 
 
66 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  65.52 
 
 
61 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  65.52 
 
 
58 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  65.52 
 
 
58 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  60 
 
 
71 aa  77.8  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  59.32 
 
 
71 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  65.52 
 
 
58 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3793  30S ribosomal protein S21  77.42 
 
 
65 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  56.67 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3698  30S ribosomal protein S21  77.42 
 
 
65 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4051  30S ribosomal protein S21  77.42 
 
 
65 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747096  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  61.67 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  61.67 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  58.06 
 
 
71 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0391  30S ribosomal protein S21  75.81 
 
 
65 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  60 
 
 
58 aa  73.6  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  56.67 
 
 
71 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  62.96 
 
 
60 aa  72.8  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  57.38 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  56.67 
 
 
71 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  56.67 
 
 
71 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  58.62 
 
 
58 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 
71 aa  72  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  56.67 
 
 
71 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 
71 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  58.06 
 
 
71 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  54.84 
 
 
71 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  54.84 
 
 
71 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  54.84 
 
 
71 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  55 
 
 
71 aa  71.2  0.000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  62.9 
 
 
67 aa  71.2  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  54.1 
 
 
70 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 
71 aa  70.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  56.67 
 
 
71 aa  70.5  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  54.1 
 
 
70 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  54.1 
 
 
70 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
58 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  53.23 
 
 
71 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 
70 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  59.26 
 
 
60 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 
57 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  52.46 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  50.82 
 
 
70 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  52.46 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  58.18 
 
 
59 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  56.36 
 
 
59 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1781  30S ribosomal protein S21  54.84 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.966323  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
58 aa  67.4  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0396  30S ribosomal protein S21  54.84 
 
 
86 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  60 
 
 
58 aa  67.4  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  52.46 
 
 
70 aa  67.4  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  52.46 
 
 
70 aa  67  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3780  30S ribosomal protein S21  54.1 
 
 
70 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792875  normal  0.0326962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3254  30S ribosomal protein S21  54.1 
 
 
70 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0163212 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  53.23 
 
 
71 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  53.33 
 
 
71 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000175133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  50.82 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  52.46 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  51.67 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  53.23 
 
 
71 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0660  30S ribosomal protein S21  59.68 
 
 
71 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186503  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  50.82 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
57 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  50.82 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2363  30S ribosomal protein S21  50.82 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929695  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>