More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1898 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 66 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  68.25 
 
 		 65 aa  87  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  69.84 
 
 		 65 aa  85.9  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  68.25 
 
 		 65 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  60 
 
 		 67 aa  79.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1089  30S ribosomal protein S21  72.73 
 
 		 67 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1366  30S ribosomal protein S21  74.24 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0498  30S ribosomal protein S21  72.73 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000416793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2461  ribosomal protein S21  84.62 
 
 		 60 aa  70.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0201196  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  51.67 
 
 		 71 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  47.89 
 
 		 71 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  49.23 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  51.72 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  55 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  55 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  50.85 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2056  30S ribosomal protein S21  71.21 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.908846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  51.67 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  51.67 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  51.67 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 70 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  51.72 
 
 		 58 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  51.72 
 
 		 58 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4051  30S ribosomal protein S21  68.25 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3793  30S ribosomal protein S21  68.25 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  56.36 
 
 		 57 aa  66.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  67  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3698  30S ribosomal protein S21  68.25 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 		 58 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  51.72 
 
 		 58 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0391  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000175133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 58 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0396  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1781  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.966323  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  44.62 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  44.62 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  48.28 
 
 		 58 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  46.77 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  46.77 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  46.77 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  44.62 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  48.28 
 
 		 58 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  44.62 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3830  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  51.85 
 
 		 58 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0105  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.759736  normal  0.539683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  45.9 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2987  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196552 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 		 57 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  64.52 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 		 58 aa  62.8  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0170  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0152  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926956 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2872  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0089  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3344  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3447  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3195  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  62  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  46.77 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0224  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2865  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631182  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1672  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3103  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0811992  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0157  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  46.55 
 
 		 58 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 		 58 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0242  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  64.52 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2363  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  48.33 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  41.54 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  64.52 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3869  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1056  ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3950  30S ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>