More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1774 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
57 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  81.48 
 
 
58 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  81.82 
 
 
57 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  68.42 
 
 
58 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0129  ribosomal protein S21  71.43 
 
 
58 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000000381308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  64.91 
 
 
59 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  62.5 
 
 
61 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 
58 aa  77.4  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  62.5 
 
 
59 aa  77  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 
58 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  60.71 
 
 
58 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  63.16 
 
 
60 aa  73.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 
58 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  60.71 
 
 
58 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  60.71 
 
 
58 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3215  ribosomal protein S21  64 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603816  hitchhiker  0.00000000377258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  56.14 
 
 
57 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1056  ribosomal protein S21  78.57 
 
 
66 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  56.14 
 
 
60 aa  71.6  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4447  30S ribosomal protein S21  59.65 
 
 
58 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657819  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1918  30S ribosomal protein S21  57.89 
 
 
58 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 
58 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1344  30S ribosomal protein S21  57.89 
 
 
59 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  56.14 
 
 
58 aa  67  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  60.71 
 
 
65 aa  66.6  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1330  30S ribosomal protein S21  57.45 
 
 
56 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233824  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  54.39 
 
 
58 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  60 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  60 
 
 
71 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4602  30S ribosomal protein S21  50.88 
 
 
62 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849069  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1119  30S ribosomal protein S21  54.39 
 
 
61 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  58.18 
 
 
70 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0951  30S ribosomal protein S21  52.63 
 
 
61 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  58.18 
 
 
71 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  60 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0978  30S ribosomal protein S21  52.63 
 
 
61 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0783666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  56.36 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1020  30S ribosomal protein S21  55.36 
 
 
57 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  55.36 
 
 
57 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  55.36 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0963  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
58 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1064  30S ribosomal protein S21  56.9 
 
 
58 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  58.18 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
58 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1429  30S ribosomal protein S21  52.63 
 
 
58 aa  61.6  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000209576  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10681  30S ribosomal protein S21  50.88 
 
 
58 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0404738  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  56.36 
 
 
71 aa  61.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1667  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
58 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  56.36 
 
 
71 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
58 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10661  30S ribosomal protein S21  50.88 
 
 
58 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1060  30S ribosomal protein S21  56 
 
 
58 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19351  30S ribosomal protein S21  56 
 
 
58 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.564585  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 
71 aa  60.8  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0993  30S ribosomal protein S21  50.88 
 
 
58 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.149437  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10681  30S ribosomal protein S21  50.88 
 
 
58 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.267781  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11801  30S ribosomal protein S21  56 
 
 
58 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.216107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  54.55 
 
 
77 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4662  30S ribosomal protein S21  52.63 
 
 
64 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
71 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
71 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4442  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
57 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000763687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4390  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
57 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.994986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4208  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
57 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4046  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
57 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4056  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
57 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.156818  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 
71 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4160  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
57 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4534  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
57 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 
71 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4331  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
57 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7009999999999997e-53 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0808  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
57 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.010584  decreased coverage  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4427  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
57 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  52.73 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  53.57 
 
 
70 aa  60.1  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 
70 aa  60.1  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3035  30S ribosomal protein S21  51.79 
 
 
57 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00632244  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  59.52 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0350  30S ribosomal protein S21  55.56 
 
 
64 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000144824  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10611  30S ribosomal protein S21  52 
 
 
58 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_290  ribosomal protein S21  55.56 
 
 
64 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000295675  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0329  30S ribosomal protein S21  55.56 
 
 
64 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000310011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  59.52 
 
 
64 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  59.52 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  59.52 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 
70 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4643  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 
62 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0890115  normal  0.0585031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>