More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0498 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0498  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 67 aa  134  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000416793 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1089  30S ribosomal protein S21  92.54 
 
 		 67 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1366  30S ribosomal protein S21  95.52 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  72.73 
 
 		 66 aa  97.1  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2056  30S ribosomal protein S21  91.04 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.908846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  67.19 
 
 		 65 aa  84  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  64.06 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  64.06 
 
 		 65 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  55.38 
 
 		 71 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  55.38 
 
 		 71 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  55.38 
 
 		 71 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  56.92 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000175133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  55.38 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  53.85 
 
 		 71 aa  70.1  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  52.24 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  54.1 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  67  0.00000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  53.97 
 
 		 71 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  53.97 
 
 		 71 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  53.03 
 
 		 71 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  53.97 
 
 		 71 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  53.03 
 
 		 71 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  55 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  46.97 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  60.71 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  48.48 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  50.79 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  48.48 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  53.03 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 58 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 58 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  52.38 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0242  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0152  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926956 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0170  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  52.24 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0224  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3344  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2865  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631182  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0157  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565794  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3103  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0811992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2872  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0089  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3830  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3195  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3447  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0105  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.759736  normal  0.539683 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1672  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  46.97 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 58 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  46.97 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2987  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  46.97 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  46.97 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  46.97 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3869  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  48.48 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  48.48 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3950  30S ribosomal protein S21  48.39 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  55 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  55 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  44.62 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 		 58 aa  63.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 58 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 		 58 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3793  30S ribosomal protein S21  64.06 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3698  30S ribosomal protein S21  64.06 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 58 aa  62.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4051  30S ribosomal protein S21  64.06 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 58 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 		 58 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>