287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2385 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 70 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  81.43 
 
 		 70 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  84.29 
 
 		 70 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  80 
 
 		 70 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  81.43 
 
 		 70 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  81.43 
 
 		 70 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  81.43 
 
 		 70 aa  114  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  80 
 
 		 70 aa  114  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  80 
 
 		 70 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  80 
 
 		 70 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  80 
 
 		 70 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  80 
 
 		 70 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  77.14 
 
 		 70 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  77.14 
 
 		 70 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  80 
 
 		 70 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  77.14 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  78.57 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2363  30S ribosomal protein S21  75.71 
 
 		 70 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3780  30S ribosomal protein S21  77.14 
 
 		 70 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792875  normal  0.0326962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3254  30S ribosomal protein S21  77.14 
 
 		 70 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0163212 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  77.14 
 
 		 70 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  75.71 
 
 		 70 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  74.29 
 
 		 70 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  77.14 
 
 		 70 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  75 
 
 		 71 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  75 
 
 		 71 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  75 
 
 		 71 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  78.33 
 
 		 71 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  94  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  70.31 
 
 		 71 aa  93.6  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3950  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 87 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1672  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3869  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 87 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2872  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3447  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0089  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3344  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3103  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0811992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3195  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0224  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0152  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926956 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2865  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0170  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0157  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0242  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  75 
 
 		 71 aa  91.3  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  73.44 
 
 		 71 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2987  30S ribosomal protein S21  65.71 
 
 		 70 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196552 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  72.88 
 
 		 71 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3830  30S ribosomal protein S21  65.71 
 
 		 70 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0105  30S ribosomal protein S21  65.71 
 
 		 70 aa  90.5  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.759736  normal  0.539683 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  63.38 
 
 		 71 aa  90.1  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  71.88 
 
 		 71 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  73.33 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1419  30S ribosomal protein S21  75.71 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1701  30S ribosomal protein S21  75.71 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  74.58 
 
 		 71 aa  88.2  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  74.58 
 
 		 71 aa  88.2  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  66.2 
 
 		 71 aa  87.8  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000175133  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 71 aa  87.4  6e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  74.58 
 
 		 71 aa  87.4  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  61.97 
 
 		 71 aa  87  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  61.97 
 
 		 71 aa  87  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  65 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  72.88 
 
 		 71 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  71.67 
 
 		 71 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>