272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2473 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2473  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 69 aa  137  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000983176  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0262  30S ribosomal protein S21  62.9 
 
 		 69 aa  80.1  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0918517  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  53.12 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  46.88 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  52.94 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  41.54 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0314  ribosomal protein S21  55.81 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555327 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  40 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0129  ribosomal protein S21  47.27 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000000381308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  44.62 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  44.12 
 
 		 79 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  44.12 
 
 		 79 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  46.55 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  46.55 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0896  30S ribosomal protein S21  38.81 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.82181  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0389  30S ribosomal protein S21  38.81 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1667  30S ribosomal protein S21  46.55 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1947  30S ribosomal protein S21  38.81 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1001  30S ribosomal protein S21  40.3 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1856  30S ribosomal protein S21  38.81 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  41.94 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  41.94 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  36.62 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  44.62 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  45.16 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  53.49 
 
 		 93 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  41.38 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  41.38 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1429  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000209576  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1303  30S ribosomal protein S21  42.62 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000518978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4390  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 57 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.994986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4160  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 57 aa  50.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4208  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 57 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4046  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 57 aa  50.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4056  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 57 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.156818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4427  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 57 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4331  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 57 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7009999999999997e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4442  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 57 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000763687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  41.94 
 
 		 71 aa  50.1  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000175133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4534  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 57 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0808  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 57 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.010584  decreased coverage  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1089  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  41.94 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  41.94 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  41.82 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  44.62 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0391  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3035  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00632244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  41.94 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  40.32 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  45.83 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  43.1 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0984  30S ribosomal protein S21  39.34 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1075  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.015227  normal  0.70194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3830  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2872  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2987  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1156  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000152947  normal  0.0305894 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0089  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0224  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3344  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3103  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0811992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1672  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3195  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0105  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.759736  normal  0.539683 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  43.64 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3950  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3869  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2865  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0170  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  34.78 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0157  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  50.98 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0242  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0152  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926956 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  43.1 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3447  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3793  30S ribosomal protein S21  44.62 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  39.34 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0728  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000434468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>