162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2093 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2093  ribosomal protein S21  100 
 
 		 65 aa  125  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.320771  normal  0.211953 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0416  ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  42.62 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3397  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.616892  normal  0.237607 
 
 
-
 
NC_002620  TC0620  30S ribosomal protein S21  47.5 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1544  30S ribosomal protein S21  44.07 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.27547  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0087  ribosomal protein S21  42.42 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00102133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  51.11 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0419  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.723054  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1556  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  43.48 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0122  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0393  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1587  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1330  30S ribosomal protein S21  41.3 
 
 		 56 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233824  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  39.13 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2369  ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.688935  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  39.13 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1288  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  40 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2831  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000453296  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2905  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000815999  normal  0.0381959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2987  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000114184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2993  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0342292  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3084  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000168191  hitchhiker  0.000271061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1147  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000110786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3166  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000179646  normal  0.223095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0999  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000187579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1107  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000130678  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1191  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000011604  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0039  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0961  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000165734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1224  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000866811  normal  0.520215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0826  30S ribosomal protein S21  47.37 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1156  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000152947  normal  0.0305894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1075  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.015227  normal  0.70194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  37.78 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3891  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  37.78 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  37.78 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3994  SSU ribosomal protein S21P  47.17 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.756973  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  38.78 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  38.78 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6336  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  38.78 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  38.78 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  38.78 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  37.78 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1208  30S ribosomal protein S21  40.82 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  38.78 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  38.78 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1775  SSU ribosomal protein S21P  47.5 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000600029  decreased coverage  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  38.78 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  38.78 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  37.78 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  38.78 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  38.78 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6460  30S ribosomal protein S21  37.5 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0246  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2363  30S ribosomal protein S21  37.78 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  38.78 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  43.18 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>