213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0620 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0620  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 58 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2093  ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.320771  normal  0.211953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  46.3 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  46.3 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0416  ribosomal protein S21  48.15 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  50.94 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000175133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  54.35 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0094  ribosomal protein S21  50 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  42.59 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  42.11 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  40.74 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  42.11 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  42.59 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1429  30S ribosomal protein S21  46.3 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000209576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  35.19 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  42.59 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2255  30S ribosomal protein S21  40.43 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000394301  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  46.43 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  46.43 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  46.43 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3994  SSU ribosomal protein S21P  51.06 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.756973  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0389  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0129  ribosomal protein S21  39.66 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000000381308  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  40.74 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1208  30S ribosomal protein S21  46.94 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  42.59 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0420  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0313754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4813  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.32458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0423  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2369  ribosomal protein S21  41.18 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.688935  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4071  30S ribosomal protein S21  51.06 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3777  30S ribosomal protein S21  51.06 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0857629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0684  30S ribosomal protein S21  51.06 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.42682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5536  30S ribosomal protein S21  51.06 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725076  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4033  30S ribosomal protein S21  51.06 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07560  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.146275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46980  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0722  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0826  30S ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1490  30S ribosomal protein S21  51.06 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  40.74 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4026  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  37.04 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  37.04 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1288  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0961  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000165734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2831  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000453296  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2905  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000815999  normal  0.0381959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2987  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000114184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2993  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0342292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3166  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000179646  normal  0.223095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  42.59 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1191  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000011604  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1147  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000110786  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5585  30S ribosomal protein S21  40.68 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0999  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000187579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1107  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000130678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>