130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4071 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4071  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 105 aa  201  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3777  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 105 aa  201  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0857629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4033  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5536  30S ribosomal protein S21  81.08 
 
 		 111 aa  153  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725076  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1490  30S ribosomal protein S21  98.68 
 
 		 96 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0684  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 97 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.42682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4529  30S ribosomal protein S21  72.53 
 
 		 91 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4656  30S ribosomal protein S21  78.31 
 
 		 87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1546  ribosomal protein S21  79.01 
 
 		 111 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7554  30S ribosomal protein S21  58.33 
 
 		 99 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3775  30S ribosomal protein S21  78.48 
 
 		 79 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3994  SSU ribosomal protein S21P  85.29 
 
 		 75 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.756973  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4259  30S ribosomal protein S21  73.81 
 
 		 82 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4580  30S ribosomal protein S21  75.34 
 
 		 77 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.44401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1951  30S ribosomal protein S21  79.17 
 
 		 78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258071  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1445  30S ribosomal protein S21  78.48 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.815794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2753  30S ribosomal protein S21  82.86 
 
 		 71 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1422  30S ribosomal protein S21  78.48 
 
 		 100 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0811  30S ribosomal protein S21  79.17 
 
 		 78 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0924  30S ribosomal protein S21  79.17 
 
 		 79 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0294351  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3664  30S ribosomal protein S21  81.43 
 
 		 71 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159023  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3362  30S ribosomal protein S21  82.61 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6336  30S ribosomal protein S21  71.6 
 
 		 78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0999  30S ribosomal protein S21  80 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2287  30S ribosomal protein S21  74.68 
 
 		 79 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3962  30S ribosomal protein S21  80 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1233  30S ribosomal protein S21  80 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6850  30S ribosomal protein S21  80 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321881  normal  0.688892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0318  30S ribosomal protein S21  77.63 
 
 		 79 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124405  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0302  30S ribosomal protein S21  78.26 
 
 		 77 aa  107  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2519  30S ribosomal protein S21  76.47 
 
 		 68 aa  103  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3283  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0246  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 68 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2267  30S ribosomal protein S21  76.47 
 
 		 68 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399019  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3891  30S ribosomal protein S21  73.53 
 
 		 68 aa  100  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0718  30S ribosomal protein S21  73.53 
 
 		 68 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0404324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2373  30S ribosomal protein S21  73.53 
 
 		 68 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2437  30S ribosomal protein S21  73.53 
 
 		 68 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0560968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1043  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 		 80 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0966  30S ribosomal protein S21  78.48 
 
 		 75 aa  97.1  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14611  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0906  30S ribosomal protein S21  78.48 
 
 		 75 aa  97.1  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6014  ribosomal protein S21  68.06 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1391  30S ribosomal protein S21  82.86 
 
 		 75 aa  94.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2800  30S ribosomal protein S21  81.43 
 
 		 76 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.556498  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2835  30S ribosomal protein S21  71.21 
 
 		 68 aa  93.6  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0730941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1253  ribosomal protein S21  77.33 
 
 		 76 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193368  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2562  SSU ribosomal protein S21P  69.51 
 
 		 92 aa  88.2  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2067  ribosomal protein S21  72.6 
 
 		 73 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000824864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0900  30S ribosomal protein S21  73.61 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2255  30S ribosomal protein S21  62.71 
 
 		 64 aa  76.6  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000394301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1775  SSU ribosomal protein S21P  72.55 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000600029  decreased coverage  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0373  30S ribosomal protein S21  76.12 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1039  30S ribosomal protein S21  68.66 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823264  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3869  SSU ribosomal protein S21P  67.16 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0906  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0094  ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0468  ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000123547  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0896  30S ribosomal protein S21  39.68 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.82181  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0389  30S ribosomal protein S21  39.68 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1947  30S ribosomal protein S21  39.68 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1856  30S ribosomal protein S21  39.68 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  49.02 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0978  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0149  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000244084  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1001  30S ribosomal protein S21  36.51 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5595  30S ribosomal protein S21  41.18 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5959  30S ribosomal protein S21  41.18 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5802  30S ribosomal protein S21  39.22 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5585  30S ribosomal protein S21  39.22 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 64 aa  42  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0797  ribosomal protein S21  41.18 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.914511  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1366  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  49.06 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1089  30S ribosomal protein S21  47.37 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  41.82 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6460  30S ribosomal protein S21  39.22 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  37.93 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  41.79 
 
 		 71 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0620  30S ribosomal protein S21  53.12 
 
 		 58 aa  42  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  41.79 
 
 		 71 aa  42  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 58 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  41.79 
 
 		 71 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  41.79 
 
 		 71 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0097  ribosomal protein S21  36.21 
 
 		 65 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  41.79 
 
 		 71 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  45.83 
 
 		 59 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  41.79 
 
 		 71 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  41.79 
 
 		 71 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  41.79 
 
 		 71 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  41.79 
 
 		 71 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  41.79 
 
 		 71 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  41.79 
 
 		 71 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  41.79 
 
 		 71 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  41.79 
 
 		 71 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  41.79 
 
 		 71 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>