140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0416 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0416  ribosomal protein S21  100 
 
 		 83 aa  162  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2093  ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.320771  normal  0.211953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  47.17 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  48.21 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4602  30S ribosomal protein S21  38.71 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0094  ribosomal protein S21  52.83 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0951  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0978  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0783666 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4533  ribosomal protein S21  37.1 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.309152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4643  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0890115  normal  0.0585031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  40.98 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  41.82 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  42.86 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  39.34 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  46.43 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1918  30S ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  43.1 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  45.28 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  40.82 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4447  30S ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 58 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5802  30S ribosomal protein S21  38.98 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  42.11 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5585  30S ribosomal protein S21  38.98 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1303  30S ribosomal protein S21  42.62 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000518978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5595  30S ribosomal protein S21  37.29 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5959  30S ribosomal protein S21  37.29 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  36.51 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_002620  TC0620  30S ribosomal protein S21  53.66 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1119  30S ribosomal protein S21  40.74 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0097  ribosomal protein S21  35.29 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6460  30S ribosomal protein S21  37.29 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0385  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4662  30S ribosomal protein S21  40.82 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2872  30S ribosomal protein S21  39.58 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.731741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00075  ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3254  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0163212 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  42.11 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3249  30S ribosomal protein S21  39.58 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3780  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792875  normal  0.0326962 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1330  30S ribosomal protein S21  46.81 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  37.7 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  37.5 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>