179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2255 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2255  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 64 aa  120  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000394301  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5536  30S ribosomal protein S21  62.71 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725076  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4033  30S ribosomal protein S21  62.71 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4071  30S ribosomal protein S21  62.71 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1490  30S ribosomal protein S21  62.71 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3777  30S ribosomal protein S21  62.71 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0857629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0684  30S ribosomal protein S21  62.71 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.42682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0906  30S ribosomal protein S21  59.68 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2753  30S ribosomal protein S21  62.5 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0718  30S ribosomal protein S21  61.02 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0404324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2373  30S ribosomal protein S21  61.02 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2437  30S ribosomal protein S21  61.02 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0560968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3664  30S ribosomal protein S21  60.71 
 
 		 71 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159023  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1546  ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3362  30S ribosomal protein S21  60.71 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0302  30S ribosomal protein S21  60.71 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4259  30S ribosomal protein S21  62.71 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3775  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1775  SSU ribosomal protein S21P  64 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000600029  decreased coverage  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2267  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399019  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0468  ribosomal protein S21  58.18 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000123547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0094  ribosomal protein S21  55.17 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4529  30S ribosomal protein S21  60.71 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3994  SSU ribosomal protein S21P  60.71 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.756973  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3891  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 68 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1951  30S ribosomal protein S21  60.71 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258071  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0924  30S ribosomal protein S21  61.02 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0294351  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0318  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 		 79 aa  67  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124405  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0811  30S ribosomal protein S21  62.5 
 
 		 78 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4580  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.44401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0246  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7554  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6336  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2287  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4656  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1422  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2519  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2067  ribosomal protein S21  62 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000824864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1445  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.815794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0999  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1233  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110904  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2835  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0730941  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3962  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6850  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321881  normal  0.688892 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0966  30S ribosomal protein S21  60 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14611  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1391  30S ribosomal protein S21  60 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3283  30S ribosomal protein S21  55.36 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2800  30S ribosomal protein S21  60 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.556498  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0906  30S ribosomal protein S21  60 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1253  ribosomal protein S21  60 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193368  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2562  SSU ribosomal protein S21P  60 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6014  ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1043  30S ribosomal protein S21  55.36 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1039  30S ribosomal protein S21  64.29 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823264  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3869  SSU ribosomal protein S21P  64.29 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0900  30S ribosomal protein S21  56 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0373  30S ribosomal protein S21  62.5 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1227  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000014804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2294  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2455  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000271386  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  47.17 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  45.9 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2473  30S ribosomal protein S21  42.62 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000983176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0896  30S ribosomal protein S21  42.62 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.82181  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0389  30S ribosomal protein S21  42.62 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1947  30S ribosomal protein S21  42.62 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1856  30S ribosomal protein S21  42.62 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0262  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0918517  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1001  30S ribosomal protein S21  40.98 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  44.83 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  44.83 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1667  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0978  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0984  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624042  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1429  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 58 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000209576  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0149  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000244084  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  43.1 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2987  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196552 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4390  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.994986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4208  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  44 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0808  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.010584  decreased coverage  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4534  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4442  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000763687  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0105  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.759736  normal  0.539683 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  42.11 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4331  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7009999999999997e-53 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>