120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2835 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2835  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 68 aa  130  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0730941  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1043  30S ribosomal protein S21  86.36 
 
 		 80 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3283  30S ribosomal protein S21  80.3 
 
 		 67 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2519  30S ribosomal protein S21  80.3 
 
 		 68 aa  107  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2287  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 79 aa  107  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0999  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 95 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1233  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 95 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110904  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1445  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.815794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3891  30S ribosomal protein S21  80.3 
 
 		 68 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3962  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1422  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 100 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6850  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321881  normal  0.688892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0246  30S ribosomal protein S21  77.61 
 
 		 68 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4656  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0302  30S ribosomal protein S21  77.27 
 
 		 77 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0318  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 79 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124405  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0718  30S ribosomal protein S21  79.1 
 
 		 68 aa  104  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2267  30S ribosomal protein S21  79.1 
 
 		 68 aa  104  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399019  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2373  30S ribosomal protein S21  79.1 
 
 		 68 aa  104  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2437  30S ribosomal protein S21  79.1 
 
 		 68 aa  104  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0560968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3664  30S ribosomal protein S21  76.12 
 
 		 71 aa  103  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159023  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3362  30S ribosomal protein S21  77.27 
 
 		 70 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2753  30S ribosomal protein S21  77.27 
 
 		 71 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3775  30S ribosomal protein S21  75.76 
 
 		 79 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3994  SSU ribosomal protein S21P  75.76 
 
 		 75 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.756973  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1951  30S ribosomal protein S21  74.24 
 
 		 78 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258071  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0924  30S ribosomal protein S21  75.76 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0294351  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0811  30S ribosomal protein S21  75.76 
 
 		 78 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1039  30S ribosomal protein S21  91.18 
 
 		 68 aa  98.6  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823264  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3869  SSU ribosomal protein S21P  89.71 
 
 		 81 aa  98.2  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4529  30S ribosomal protein S21  72.73 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6014  ribosomal protein S21  73.13 
 
 		 79 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4259  30S ribosomal protein S21  71.21 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0966  30S ribosomal protein S21  81.82 
 
 		 75 aa  92.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2800  30S ribosomal protein S21  81.82 
 
 		 76 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.556498  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0906  30S ribosomal protein S21  81.82 
 
 		 75 aa  92.8  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5536  30S ribosomal protein S21  71.21 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725076  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1391  30S ribosomal protein S21  81.82 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3777  30S ribosomal protein S21  71.21 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0857629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6336  30S ribosomal protein S21  69.7 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4033  30S ribosomal protein S21  71.21 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4071  30S ribosomal protein S21  71.21 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0684  30S ribosomal protein S21  71.21 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.42682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1490  30S ribosomal protein S21  71.21 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4580  30S ribosomal protein S21  69.7 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.44401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1253  ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 76 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193368  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2067  ribosomal protein S21  82.35 
 
 		 73 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000824864 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0373  30S ribosomal protein S21  84.85 
 
 		 67 aa  87.8  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1546  ribosomal protein S21  62.12 
 
 		 111 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7554  30S ribosomal protein S21  65.15 
 
 		 99 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2562  SSU ribosomal protein S21P  74.24 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0900  30S ribosomal protein S21  75.76 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1775  SSU ribosomal protein S21P  64.71 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000600029  decreased coverage  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2255  30S ribosomal protein S21  58.93 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000394301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0906  30S ribosomal protein S21  51.61 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0149  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000244084  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0978  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0468  ribosomal protein S21  42.62 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000123547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0094  ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  49.02 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0896  30S ribosomal protein S21  41.38 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.82181  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0389  30S ribosomal protein S21  41.38 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1947  30S ribosomal protein S21  41.38 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1856  30S ribosomal protein S21  41.38 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  40.98 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1918  30S ribosomal protein S21  42.11 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4602  30S ribosomal protein S21  42.59 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849069  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  42 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4447  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4643  30S ribosomal protein S21  40.82 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0890115  normal  0.0585031 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1001  30S ribosomal protein S21  40.74 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  42 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  42 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  38.98 
 
 		 66 aa  42  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 57 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 59 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0978  30S ribosomal protein S21  40.43 
 
 		 61 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0783666 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0951  30S ribosomal protein S21  40.43 
 
 		 61 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2056  30S ribosomal protein S21  52.5 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.908846  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0396  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1781  30S ribosomal protein S21  40.32 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.966323  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1330  30S ribosomal protein S21  47.5 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233824  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0827  ribosomal protein S21  48.15 
 
 		 64 aa  40.4  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0760536  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 58 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1366  30S ribosomal protein S21  52.94 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1089  30S ribosomal protein S21  52.94 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  42.11 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>