101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0906 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0906  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 66 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2255  30S ribosomal protein S21  59.68 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000394301  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0718  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0404324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2373  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2437  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0560968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5536  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725076  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7554  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3777  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0857629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0684  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.42682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4033  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4071  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1490  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2267  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399019  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0246  30S ribosomal protein S21  61.02 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3891  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 68 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2519  30S ribosomal protein S21  59.32 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3283  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4656  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0999  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1445  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.815794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1422  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1233  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110904  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3962  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6850  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321881  normal  0.688892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4529  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3994  SSU ribosomal protein S21P  54.24 
 
 		 75 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.756973  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0302  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2287  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0811  30S ribosomal protein S21  54.24 
 
 		 78 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3362  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3775  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4259  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0924  30S ribosomal protein S21  54.24 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0294351  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3664  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159023  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0966  30S ribosomal protein S21  60 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2800  30S ribosomal protein S21  60 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.556498  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0906  30S ribosomal protein S21  60 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1951  30S ribosomal protein S21  54.24 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258071  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6336  30S ribosomal protein S21  52.54 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2835  30S ribosomal protein S21  51.61 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0730941  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1391  30S ribosomal protein S21  60 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4580  30S ribosomal protein S21  52.54 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.44401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2753  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0318  30S ribosomal protein S21  54.24 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124405  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1253  ribosomal protein S21  58 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193368  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2562  SSU ribosomal protein S21P  56 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1546  ribosomal protein S21  49.15 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1043  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0468  ribosomal protein S21  50 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000123547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1775  SSU ribosomal protein S21P  54 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000600029  decreased coverage  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1039  30S ribosomal protein S21  62.5 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823264  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3869  SSU ribosomal protein S21P  62.5 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0373  30S ribosomal protein S21  65 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2067  ribosomal protein S21  56 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000824864 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6014  ribosomal protein S21  50.85 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0900  30S ribosomal protein S21  52 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0094  ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 73 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  52.94 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  53.57 
 
 		 58 aa  47.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 57 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 58 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  48.98 
 
 		 57 aa  43.5  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  48.89 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  41.18 
 
 		 60 aa  42.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1429  30S ribosomal protein S21  50.98 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000209576  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  47.27 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  39.66 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1344  30S ribosomal protein S21  42 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  46 
 
 		 57 aa  42  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1020  30S ribosomal protein S21  46 
 
 		 57 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0149  30S ribosomal protein S21  40.68 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000244084  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4602  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5802  30S ribosomal protein S21  35.94 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5585  30S ribosomal protein S21  35.94 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3215  ribosomal protein S21  46.81 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603816  hitchhiker  0.00000000377258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1918  30S ribosomal protein S21  41.82 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  42.55 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0978  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  47.83 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4447  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6460  30S ribosomal protein S21  34.38 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5595  30S ribosomal protein S21  34.92 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5959  30S ribosomal protein S21  34.92 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00751  30S ribosomal protein S21  40.74 
 
 		 56 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.17541  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  46 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  46 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1667  30S ribosomal protein S21  46 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1119  30S ribosomal protein S21  35.09 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>