104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6336 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6336  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 78 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4580  30S ribosomal protein S21  90.79 
 
 		 77 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.44401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1951  30S ribosomal protein S21  79.49 
 
 		 78 aa  123  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258071  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0811  30S ribosomal protein S21  80.77 
 
 		 78 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0924  30S ribosomal protein S21  82.43 
 
 		 79 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0294351  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3994  SSU ribosomal protein S21P  80 
 
 		 75 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.756973  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4259  30S ribosomal protein S21  76.62 
 
 		 82 aa  117  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1546  ribosomal protein S21  75.68 
 
 		 111 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4529  30S ribosomal protein S21  77.46 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7554  30S ribosomal protein S21  76.06 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2287  30S ribosomal protein S21  74.68 
 
 		 79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3775  30S ribosomal protein S21  74.67 
 
 		 79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4033  30S ribosomal protein S21  71.6 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3777  30S ribosomal protein S21  71.6 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0857629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0318  30S ribosomal protein S21  79.71 
 
 		 79 aa  107  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124405  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4071  30S ribosomal protein S21  71.6 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0684  30S ribosomal protein S21  75 
 
 		 97 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.42682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1490  30S ribosomal protein S21  75 
 
 		 96 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0999  30S ribosomal protein S21  78.26 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1233  30S ribosomal protein S21  78.26 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110904  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5536  30S ribosomal protein S21  75 
 
 		 111 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725076  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1445  30S ribosomal protein S21  76.81 
 
 		 101 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.815794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1422  30S ribosomal protein S21  76.81 
 
 		 100 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4656  30S ribosomal protein S21  72 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3962  30S ribosomal protein S21  76.81 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6850  30S ribosomal protein S21  76.81 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321881  normal  0.688892 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0302  30S ribosomal protein S21  71.79 
 
 		 77 aa  104  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3891  30S ribosomal protein S21  75 
 
 		 68 aa  100  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2753  30S ribosomal protein S21  72.86 
 
 		 71 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3362  30S ribosomal protein S21  75 
 
 		 70 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3664  30S ribosomal protein S21  71.43 
 
 		 71 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159023  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3283  30S ribosomal protein S21  73.13 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2519  30S ribosomal protein S21  73.53 
 
 		 68 aa  97.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2800  30S ribosomal protein S21  74.36 
 
 		 76 aa  97.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.556498  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0966  30S ribosomal protein S21  73.68 
 
 		 75 aa  96.7  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14611  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0906  30S ribosomal protein S21  73.68 
 
 		 75 aa  96.7  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1043  30S ribosomal protein S21  71.64 
 
 		 80 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0246  30S ribosomal protein S21  73.53 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1391  30S ribosomal protein S21  75.71 
 
 		 75 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1253  ribosomal protein S21  74.29 
 
 		 76 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193368  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0900  30S ribosomal protein S21  65.38 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2835  30S ribosomal protein S21  69.7 
 
 		 68 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0730941  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6014  ribosomal protein S21  63.16 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0718  30S ribosomal protein S21  67.65 
 
 		 68 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2267  30S ribosomal protein S21  67.65 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399019  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2373  30S ribosomal protein S21  67.65 
 
 		 68 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2437  30S ribosomal protein S21  67.65 
 
 		 68 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0560968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2067  ribosomal protein S21  68.49 
 
 		 73 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000824864 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2562  SSU ribosomal protein S21P  69.12 
 
 		 92 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1039  30S ribosomal protein S21  68.66 
 
 		 68 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823264  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3869  SSU ribosomal protein S21P  70.15 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0373  30S ribosomal protein S21  73.13 
 
 		 67 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1775  SSU ribosomal protein S21P  74.51 
 
 		 67 aa  76.6  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000600029  decreased coverage  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2255  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000394301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0906  30S ribosomal protein S21  52.54 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0468  ribosomal protein S21  45.61 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000123547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0094  ribosomal protein S21  43.75 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0896  30S ribosomal protein S21  40.62 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.82181  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0389  30S ribosomal protein S21  40.62 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1947  30S ribosomal protein S21  40.62 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1856  30S ribosomal protein S21  40.62 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1001  30S ribosomal protein S21  37.5 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5595  30S ribosomal protein S21  39.68 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5802  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5959  30S ribosomal protein S21  39.68 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5585  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6460  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0797  ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.914511  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0978  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0149  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000244084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2987  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196552 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2872  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0089  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3195  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3447  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138674  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1672  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3869  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3950  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3103  30S ribosomal protein S21  37.7 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0811992  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2093  ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.320771  normal  0.211953 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  40.68 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 60 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0105  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.759736  normal  0.539683 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3830  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3344  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  40.68 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2865  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631182  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0157  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0242  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  37.88 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0152  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926956 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0224  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0170  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  37.5 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  37.88 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  37.88 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>