71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3283 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3283  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116244  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1043  30S ribosomal protein S21  88.06 
 
 
80 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4656  30S ribosomal protein S21  88.06 
 
 
87 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6850  30S ribosomal protein S21  88.06 
 
 
100 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321881  normal  0.688892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1422  30S ribosomal protein S21  88.06 
 
 
100 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1445  30S ribosomal protein S21  88.06 
 
 
101 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.815794  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3962  30S ribosomal protein S21  88.06 
 
 
100 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0999  30S ribosomal protein S21  86.57 
 
 
95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1233  30S ribosomal protein S21  86.57 
 
 
95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110904  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2287  30S ribosomal protein S21  83.58 
 
 
79 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0318  30S ribosomal protein S21  83.58 
 
 
79 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124405  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2835  30S ribosomal protein S21  80.3 
 
 
68 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0730941  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3891  30S ribosomal protein S21  77.61 
 
 
68 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0666745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0302  30S ribosomal protein S21  79.1 
 
 
77 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0246  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 
68 aa  107  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3775  30S ribosomal protein S21  77.61 
 
 
79 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2519  30S ribosomal protein S21  76.12 
 
 
68 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3664  30S ribosomal protein S21  79.1 
 
 
71 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159023  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3994  SSU ribosomal protein S21P  80.6 
 
 
75 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.756973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3362  30S ribosomal protein S21  79.1 
 
 
70 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17899  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2753  30S ribosomal protein S21  79.1 
 
 
71 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1951  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 
78 aa  103  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258071  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4529  30S ribosomal protein S21  77.61 
 
 
91 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5536  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 
111 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725076  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4259  30S ribosomal protein S21  76.12 
 
 
82 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2267  30S ribosomal protein S21  75.76 
 
 
68 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399019  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3777  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 
105 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0857629  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4033  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 
102 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734588  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4071  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 
105 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1490  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 
96 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0924  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 
79 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0294351  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1546  ribosomal protein S21  74.63 
 
 
111 aa  100  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0811  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 
78 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0684  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 
97 aa  100  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.42682 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2437  30S ribosomal protein S21  74.24 
 
 
68 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0560968 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0718  30S ribosomal protein S21  74.24 
 
 
68 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0404324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2373  30S ribosomal protein S21  74.24 
 
 
68 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4580  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 
77 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.44401  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6336  30S ribosomal protein S21  73.13 
 
 
78 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0373  30S ribosomal protein S21  94.03 
 
 
67 aa  97.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1253  ribosomal protein S21  85.07 
 
 
76 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193368  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2800  30S ribosomal protein S21  83.58 
 
 
76 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.556498  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0906  30S ribosomal protein S21  83.58 
 
 
75 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0966  30S ribosomal protein S21  83.58 
 
 
75 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14611  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1391  30S ribosomal protein S21  83.58 
 
 
75 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7554  30S ribosomal protein S21  70.15 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190009  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1039  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 
68 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823264  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6014  ribosomal protein S21  69.7 
 
 
79 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3869  SSU ribosomal protein S21P  78.79 
 
 
81 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174187  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2067  ribosomal protein S21  82.35 
 
 
73 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000824864 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2562  SSU ribosomal protein S21P  74.63 
 
 
92 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0900  30S ribosomal protein S21  76.12 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1775  SSU ribosomal protein S21P  66.67 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000600029  decreased coverage  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0906  30S ribosomal protein S21  55.93 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2255  30S ribosomal protein S21  55.36 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000394301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0468  ribosomal protein S21  49.18 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000123547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0094  ribosomal protein S21  50 
 
 
73 aa  52.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0978  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0149  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000244084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  43.18 
 
 
57 aa  43.9  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  41.94 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 
57 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  39.34 
 
 
65 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1366  30S ribosomal protein S21  55.88 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1089  30S ribosomal protein S21  55.88 
 
 
67 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  45.1 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  39.62 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1330  30S ribosomal protein S21  42.5 
 
 
56 aa  40.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4447  30S ribosomal protein S21  37.5 
 
 
58 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657819  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2093  ribosomal protein S21  39.06 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.320771  normal  0.211953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>