59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0468 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0468  ribosomal protein S21  100 
 
 		 68 aa  127  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000123547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2255  30S ribosomal protein S21  58.18 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000394301  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4259  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0906  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0094  ribosomal protein S21  53.12 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0246  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4529  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1951  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258071  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3283  30S ribosomal protein S21  49.18 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3994  SSU ribosomal protein S21P  47.27 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.756973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7554  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5536  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725076  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1490  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1546  ribosomal protein S21  47.37 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1445  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.815794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4656  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1233  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110904  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1422  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4071  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3777  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0857629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0999  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4033  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0684  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.42682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3962  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6850  30S ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321881  normal  0.688892 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3891  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2519  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1043  30S ribosomal protein S21  45.9 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0302  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0924  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0294351  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0811  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3664  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159023  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3362  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0318  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124405  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2287  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6014  ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2267  30S ribosomal protein S21  47.27 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399019  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3775  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2753  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0718  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0404324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2373  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2437  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0560968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1253  ribosomal protein S21  48 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193368  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0906  30S ribosomal protein S21  46 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2067  ribosomal protein S21  48 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000824864 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2562  SSU ribosomal protein S21P  48 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2800  30S ribosomal protein S21  46 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.556498  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0966  30S ribosomal protein S21  46 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14611  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1391  30S ribosomal protein S21  46 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4580  30S ribosomal protein S21  45.61 
 
 		 77 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.44401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6336  30S ribosomal protein S21  45.61 
 
 		 78 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1775  SSU ribosomal protein S21P  50 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000600029  decreased coverage  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2835  30S ribosomal protein S21  42.62 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0730941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3869  SSU ribosomal protein S21P  46.34 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1039  30S ribosomal protein S21  46.34 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823264  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0373  30S ribosomal protein S21  47.5 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0900  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  45.83 
 
 		 67 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 57 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>