144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1039 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1039  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 68 aa  130  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823264  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2835  30S ribosomal protein S21  91.18 
 
 		 68 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0730941  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3283  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 		 67 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1043  30S ribosomal protein S21  79.1 
 
 		 80 aa  110  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2287  30S ribosomal protein S21  76.12 
 
 		 79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0999  30S ribosomal protein S21  76.12 
 
 		 95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3891  30S ribosomal protein S21  77.61 
 
 		 68 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1233  30S ribosomal protein S21  76.12 
 
 		 95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110904  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4656  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1445  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.815794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3962  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 		 100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1422  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 		 100 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6850  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 		 100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321881  normal  0.688892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0318  30S ribosomal protein S21  76.12 
 
 		 79 aa  107  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124405  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2519  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 		 68 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0246  30S ribosomal protein S21  77.27 
 
 		 68 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0302  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 		 77 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3775  30S ribosomal protein S21  73.13 
 
 		 79 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3362  30S ribosomal protein S21  73.13 
 
 		 70 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3664  30S ribosomal protein S21  73.13 
 
 		 71 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159023  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0718  30S ribosomal protein S21  75.76 
 
 		 68 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3994  SSU ribosomal protein S21P  73.13 
 
 		 75 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.756973  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2373  30S ribosomal protein S21  75.76 
 
 		 68 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2437  30S ribosomal protein S21  75.76 
 
 		 68 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0560968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3869  SSU ribosomal protein S21P  94.12 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2753  30S ribosomal protein S21  73.13 
 
 		 71 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2267  30S ribosomal protein S21  74.24 
 
 		 68 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399019  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1951  30S ribosomal protein S21  70.15 
 
 		 78 aa  100  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258071  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4529  30S ribosomal protein S21  71.64 
 
 		 91 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0924  30S ribosomal protein S21  68.66 
 
 		 79 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0294351  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0811  30S ribosomal protein S21  68.66 
 
 		 78 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4259  30S ribosomal protein S21  67.16 
 
 		 82 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6336  30S ribosomal protein S21  68.66 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5536  30S ribosomal protein S21  68.66 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725076  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4580  30S ribosomal protein S21  67.16 
 
 		 77 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.44401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6014  ribosomal protein S21  69.12 
 
 		 79 aa  93.2  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4071  30S ribosomal protein S21  68.66 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0966  30S ribosomal protein S21  77.61 
 
 		 75 aa  92.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14611  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4033  30S ribosomal protein S21  68.66 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2800  30S ribosomal protein S21  77.61 
 
 		 76 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.556498  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0906  30S ribosomal protein S21  77.61 
 
 		 75 aa  92.8  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3777  30S ribosomal protein S21  68.66 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0857629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1391  30S ribosomal protein S21  77.61 
 
 		 75 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1490  30S ribosomal protein S21  68.66 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0684  30S ribosomal protein S21  68.66 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.42682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0373  30S ribosomal protein S21  85.07 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1253  ribosomal protein S21  76.12 
 
 		 76 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193368  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2067  ribosomal protein S21  80.39 
 
 		 73 aa  88.6  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000824864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1546  ribosomal protein S21  61.19 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7554  30S ribosomal protein S21  62.69 
 
 		 99 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2562  SSU ribosomal protein S21P  71.64 
 
 		 92 aa  84.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0900  30S ribosomal protein S21  73.13 
 
 		 89 aa  83.6  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1775  SSU ribosomal protein S21P  60.78 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000600029  decreased coverage  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2255  30S ribosomal protein S21  60.71 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000394301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0906  30S ribosomal protein S21  54.1 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0149  30S ribosomal protein S21  49.15 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000244084  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0978  30S ribosomal protein S21  49.15 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0468  ribosomal protein S21  44.26 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000123547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  45.9 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0896  30S ribosomal protein S21  42.19 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.82181  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0389  30S ribosomal protein S21  42.19 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1947  30S ribosomal protein S21  42.19 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1856  30S ribosomal protein S21  42.19 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0094  ribosomal protein S21  43.75 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  47.17 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1001  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  42.59 
 
 		 59 aa  43.9  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  44.9 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1330  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0396  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1781  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.966323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1918  30S ribosomal protein S21  37.93 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1366  30S ribosomal protein S21  55.88 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1089  30S ribosomal protein S21  55.88 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  40.35 
 
 		 65 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4602  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 62 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 58 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 58 aa  41.2  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  37.5 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4447  30S ribosomal protein S21  36.21 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4643  30S ribosomal protein S21  36.73 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0890115  normal  0.0585031 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0951  30S ribosomal protein S21  38.78 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0978  30S ribosomal protein S21  38.78 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0783666 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0498  30S ribosomal protein S21  59.38 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000416793 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>