72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1546 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1546  ribosomal protein S21  100 
 
 		 111 aa  212  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1951  30S ribosomal protein S21  76.92 
 
 		 78 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258071  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4071  30S ribosomal protein S21  79.01 
 
 		 105 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3777  30S ribosomal protein S21  79.01 
 
 		 105 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0857629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4033  30S ribosomal protein S21  79.01 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6336  30S ribosomal protein S21  75.68 
 
 		 78 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1490  30S ribosomal protein S21  77.92 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0924  30S ribosomal protein S21  72.73 
 
 		 79 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0294351  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0684  30S ribosomal protein S21  81.94 
 
 		 97 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.42682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5536  30S ribosomal protein S21  81.94 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725076  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4259  30S ribosomal protein S21  76 
 
 		 82 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4580  30S ribosomal protein S21  74.32 
 
 		 77 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.44401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0811  30S ribosomal protein S21  71.79 
 
 		 78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3775  30S ribosomal protein S21  72.5 
 
 		 79 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3994  SSU ribosomal protein S21P  74.32 
 
 		 75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.756973  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4529  30S ribosomal protein S21  74.65 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7554  30S ribosomal protein S21  65 
 
 		 99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2753  30S ribosomal protein S21  75.71 
 
 		 71 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0302  30S ribosomal protein S21  73.91 
 
 		 77 aa  106  8.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3664  30S ribosomal protein S21  74.29 
 
 		 71 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159023  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3362  30S ribosomal protein S21  75.36 
 
 		 70 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0318  30S ribosomal protein S21  70.89 
 
 		 79 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124405  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1233  30S ribosomal protein S21  69.62 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110904  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2287  30S ribosomal protein S21  69.62 
 
 		 79 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0999  30S ribosomal protein S21  69.62 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3962  30S ribosomal protein S21  69.62 
 
 		 100 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1422  30S ribosomal protein S21  68.75 
 
 		 100 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6850  30S ribosomal protein S21  69.62 
 
 		 100 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321881  normal  0.688892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1445  30S ribosomal protein S21  68.75 
 
 		 101 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.815794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4656  30S ribosomal protein S21  68.75 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3283  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2519  30S ribosomal protein S21  67.65 
 
 		 68 aa  97.8  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3891  30S ribosomal protein S21  67.65 
 
 		 68 aa  97.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1043  30S ribosomal protein S21  68.12 
 
 		 80 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0246  30S ribosomal protein S21  69.7 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6014  ribosomal protein S21  62.34 
 
 		 79 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2437  30S ribosomal protein S21  69.12 
 
 		 68 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0560968 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0718  30S ribosomal protein S21  69.12 
 
 		 68 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0404324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2373  30S ribosomal protein S21  69.12 
 
 		 68 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2267  30S ribosomal protein S21  67.65 
 
 		 68 aa  93.6  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399019  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1253  ribosomal protein S21  72.15 
 
 		 76 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193368  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1391  30S ribosomal protein S21  70.37 
 
 		 75 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0906  30S ribosomal protein S21  75.71 
 
 		 75 aa  90.9  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0966  30S ribosomal protein S21  75.71 
 
 		 75 aa  90.9  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2800  30S ribosomal protein S21  68.29 
 
 		 76 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.556498  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2835  30S ribosomal protein S21  62.12 
 
 		 68 aa  87.4  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0730941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0900  30S ribosomal protein S21  65.82 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2562  SSU ribosomal protein S21P  70 
 
 		 92 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2067  ribosomal protein S21  68.49 
 
 		 73 aa  84.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000824864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3869  SSU ribosomal protein S21P  56 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0373  30S ribosomal protein S21  73.13 
 
 		 67 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1775  SSU ribosomal protein S21P  64.71 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000600029  decreased coverage  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1039  30S ribosomal protein S21  61.19 
 
 		 68 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823264  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2255  30S ribosomal protein S21  57.63 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000394301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0906  30S ribosomal protein S21  49.15 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0094  ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0468  ribosomal protein S21  47.37 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000123547  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0978  30S ribosomal protein S21  43.86 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0149  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000244084  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  45 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  42.65 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  40.68 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  43.18 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  44 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  44 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  44 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  46.3 
 
 		 57 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0262  30S ribosomal protein S21  40.68 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0918517  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0827  ribosomal protein S21  42.59 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0760536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0097  ribosomal protein S21  36.84 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  48 
 
 		 57 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>