73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1043 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1043  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 80 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3283  30S ribosomal protein S21  88.06 
 
 		 67 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6850  30S ribosomal protein S21  85.07 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321881  normal  0.688892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4656  30S ribosomal protein S21  85.07 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2287  30S ribosomal protein S21  83.58 
 
 		 79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1422  30S ribosomal protein S21  85.07 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3962  30S ribosomal protein S21  85.07 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1445  30S ribosomal protein S21  85.07 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.815794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0318  30S ribosomal protein S21  85.07 
 
 		 79 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124405  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2835  30S ribosomal protein S21  86.36 
 
 		 68 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0730941  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1233  30S ribosomal protein S21  83.58 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110904  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0999  30S ribosomal protein S21  83.58 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3891  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 		 68 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0302  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 		 77 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3775  30S ribosomal protein S21  79.1 
 
 		 79 aa  107  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3362  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 		 70 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3664  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 		 71 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159023  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1951  30S ribosomal protein S21  79.1 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258071  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2519  30S ribosomal protein S21  79.1 
 
 		 68 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2753  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 		 71 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3994  SSU ribosomal protein S21P  79.1 
 
 		 75 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.756973  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0924  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 		 79 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0294351  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0811  30S ribosomal protein S21  80.6 
 
 		 78 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0246  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 68 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4529  30S ribosomal protein S21  76.12 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2437  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 68 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0560968 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2373  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 68 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.542346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4259  30S ribosomal protein S21  76.12 
 
 		 82 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2267  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 68 aa  100  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399019  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0718  30S ribosomal protein S21  78.79 
 
 		 68 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0404324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5536  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725076  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1546  ribosomal protein S21  68.12 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3777  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0857629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4033  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4580  30S ribosomal protein S21  73.13 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.44401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6336  30S ribosomal protein S21  71.64 
 
 		 78 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6014  ribosomal protein S21  77.27 
 
 		 79 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1490  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 		 96 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4071  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0684  30S ribosomal protein S21  74.63 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.42682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2562  SSU ribosomal protein S21P  74.67 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0900  30S ribosomal protein S21  80.56 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0906  30S ribosomal protein S21  83.58 
 
 		 75 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0966  30S ribosomal protein S21  83.58 
 
 		 75 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2800  30S ribosomal protein S21  83.58 
 
 		 76 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.556498  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1253  ribosomal protein S21  83.58 
 
 		 76 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193368  normal  0.239118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1391  30S ribosomal protein S21  83.58 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7554  30S ribosomal protein S21  67.16 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0373  30S ribosomal protein S21  88.06 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2067  ribosomal protein S21  86.27 
 
 		 73 aa  89.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000824864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3869  SSU ribosomal protein S21P  79.1 
 
 		 81 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1039  30S ribosomal protein S21  79.1 
 
 		 68 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823264  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1775  SSU ribosomal protein S21P  68.63 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000600029  decreased coverage  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2255  30S ribosomal protein S21  55.36 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000394301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0906  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0978  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0149  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000244084  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0468  ribosomal protein S21  45.9 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000123547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0094  ribosomal protein S21  50 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0097  ribosomal protein S21  40.35 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0827  ribosomal protein S21  47.17 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0760536  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1330  30S ribosomal protein S21  47.5 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233824  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5595  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4602  30S ribosomal protein S21  39.66 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0389  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5959  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0896  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.82181  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1947  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1856  30S ribosomal protein S21  38.89 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1918  30S ribosomal protein S21  38.98 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  45.1 
 
 		 57 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>