256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1227 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1227  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 64 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000014804  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  76.56 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  56.06 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0094  ribosomal protein S21  59.65 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  66.67 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  56.45 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  56.45 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0262  30S ribosomal protein S21  51.61 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0918517  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2473  30S ribosomal protein S21  51.72 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000983176  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  47.69 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  62.75 
 
 		 65 aa  57  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2255  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000394301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  50.77 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  57.78 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  49.23 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  65.96 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4331  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7009999999999997e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4442  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000763687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4390  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.994986  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1429  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000209576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4208  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4046  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4056  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.156818  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3035  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00632244  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4534  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4160  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0808  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.010584  decreased coverage  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4427  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150613  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  49.23 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3780  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792875  normal  0.0326962 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1667  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  52.83 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000175133  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3254  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0163212 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  49.23 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  49.23 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  55.17 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  44.62 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  53.85 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1020  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  52.83 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  52.73 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  57.69 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0984  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624042  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  47.69 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  47.69 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  53.45 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  47.69 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  47.69 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  47.69 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 		 57 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3830  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2363  30S ribosomal protein S21  47.69 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  56.25 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  61.36 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0129  ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000000381308  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  47.69 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0105  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.759736  normal  0.539683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  63.27 
 
 		 57 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2987  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196552 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  55.32 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  51.72 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  51.92 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  54.17 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  54.17 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  53.85 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1303  30S ribosomal protein S21  50.91 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000518978  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  50.94 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3950  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3869  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  50.94 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0089  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3195  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3103  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0811992  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0242  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1672  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0170  30S ribosomal protein S21  43.08 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>