209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0087 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0087  ribosomal protein S21  100 
 
 		 70 aa  140  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00102133  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0419  30S ribosomal protein S21  88.57 
 
 		 70 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.723054  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1587  30S ribosomal protein S21  88.57 
 
 		 70 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0393  30S ribosomal protein S21  88.57 
 
 		 70 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1544  30S ribosomal protein S21  87.14 
 
 		 70 aa  125  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.27547  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1556  30S ribosomal protein S21  87.14 
 
 		 74 aa  124  6e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0122  30S ribosomal protein S21  84.29 
 
 		 70 aa  122  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0039  30S ribosomal protein S21  81.43 
 
 		 70 aa  116  9e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0022  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  101  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  50.85 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  49.15 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  46.67 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  41.43 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  41.43 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  41.43 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  45 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  46.67 
 
 		 71 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  46.67 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  45 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  44.07 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  43.33 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  40.68 
 
 		 71 aa  50.1  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  40.68 
 
 		 71 aa  50.1  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000174469  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  40 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000175133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00000608143  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  41.67 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3254  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0163212 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3780  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792875  normal  0.0326962 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  44.83 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  44.83 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  37.29 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  41.38 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0389  30S ribosomal protein S21  41.43 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0423  30S ribosomal protein S21  41.43 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.736721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1918  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4026  30S ribosomal protein S21  41.43 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4813  30S ribosomal protein S21  41.43 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.32458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>