176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2124 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2124  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.487  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1943  30S ribosomal protein S21  90.77 
 
 		 65 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2176  30S ribosomal protein S21  90.77 
 
 		 65 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2278  30S ribosomal protein S21  92.31 
 
 		 65 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.166233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0283  30S ribosomal protein S21  90.77 
 
 		 65 aa  99.8  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2551  30S ribosomal protein S21  90.77 
 
 		 65 aa  97.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1632  30S ribosomal protein S21  86.15 
 
 		 65 aa  95.5  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0097  ribosomal protein S21  58.7 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  51.92 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0829  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.877836  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3397  30S ribosomal protein S21  46.88 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.616892  normal  0.237607 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  54.35 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2369  ribosomal protein S21  35.48 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.688935  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  43.64 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0839  ribosomal protein S21  54.35 
 
 		 64 aa  52  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  46.55 
 
 		 58 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0984  30S ribosomal protein S21  43.1 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624042  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1303  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000518978  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  51.16 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1933  30S ribosomal protein S21  39.29 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00075  ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  43.75 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000175133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  44.64 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  55.81 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 58 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0385  30S ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  44.07 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0262  30S ribosomal protein S21  38.6 
 
 		 69 aa  47.4  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0918517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  39.66 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1056  ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2473  30S ribosomal protein S21  41.86 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000983176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3215  ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603816  hitchhiker  0.00000000377258 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2056  30S ribosomal protein S21  54.55 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.908846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  42.19 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  41.07 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0728  30S ribosomal protein S21  45.83 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000434468  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0129  ribosomal protein S21  39.66 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000000381308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000120281  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  36.36 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1330  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  42.86 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0974  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  48.84 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0314  ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555327 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  45.24 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0498  30S ribosomal protein S21  52.27 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000416793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1041  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000208407  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  39.06 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0896  30S ribosomal protein S21  34 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.82181  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0389  30S ribosomal protein S21  34 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0042  30S ribosomal protein S21  45.24 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0926773  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  34.48 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1947  30S ribosomal protein S21  34 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1856  30S ribosomal protein S21  34 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03454  30S ribosomal protein S21  45.45 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000193859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>