228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0385 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0385  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 63 aa  121  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1933  30S ribosomal protein S21  61.9 
 
 		 64 aa  88.6  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00075  ribosomal protein S21  61.9 
 
 		 81 aa  87  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0829  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 		 64 aa  80.9  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.877836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0839  ribosomal protein S21  56.67 
 
 		 64 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  57.41 
 
 		 64 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0097  ribosomal protein S21  57.41 
 
 		 65 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3397  30S ribosomal protein S21  55.74 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.616892  normal  0.237607 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  49.15 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5595  30S ribosomal protein S21  44.07 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5959  30S ribosomal protein S21  44.07 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6460  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  52.54 
 
 		 79 aa  52  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  52.54 
 
 		 79 aa  52  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5585  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  47.17 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5802  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2987  30S ribosomal protein S21  47.46 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3830  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0105  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.759736  normal  0.539683 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5375  ribosomal protein S21  44.23 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.55538 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2872  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3950  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0089  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3103  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0811992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3195  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3780  30S ribosomal protein S21  47.17 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792875  normal  0.0326962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3254  30S ribosomal protein S21  47.17 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0163212 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3869  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3447  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138674  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1672  30S ribosomal protein S21  45.76 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0262  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0918517  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1001  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  53.49 
 
 		 93 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  47.17 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0170  30S ribosomal protein S21  44.07 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1947  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0152  30S ribosomal protein S21  44.07 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 64 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0224  30S ribosomal protein S21  44.07 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0896  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.82181  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  47.17 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0389  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2551  30S ribosomal protein S21  45.83 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3344  30S ribosomal protein S21  44.07 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1632  30S ribosomal protein S21  43.75 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 64 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2865  30S ribosomal protein S21  44.07 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631182  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0157  30S ribosomal protein S21  44.07 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1856  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0242  30S ribosomal protein S21  44.07 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  47.17 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2124  30S ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  45.28 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0314  ribosomal protein S21  44.23 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555327 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  48.08 
 
 		 58 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  48.08 
 
 		 58 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2363  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  45.28 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2473  30S ribosomal protein S21  46.51 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000983176  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  48.94 
 
 		 57 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1020  30S ribosomal protein S21  46.15 
 
 		 57 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  44.23 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  44.23 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  44.23 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1667  30S ribosomal protein S21  44.23 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  52.08 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2278  30S ribosomal protein S21  43.75 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.166233  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  44.23 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>