167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0829 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0829  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 64 aa  128  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.877836  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00075  ribosomal protein S21  76.19 
 
 		 81 aa  103  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1933  30S ribosomal protein S21  73.02 
 
 		 64 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0385  30S ribosomal protein S21  57.14 
 
 		 63 aa  80.9  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0097  ribosomal protein S21  68.52 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3927  ribosomal protein S21  66.67 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0839  ribosomal protein S21  58.62 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0141  30S ribosomal protein S21  47.54 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3397  30S ribosomal protein S21  51.85 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.616892  normal  0.237607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2124  30S ribosomal protein S21  53.49 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.487  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0283  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1943  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2278  30S ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.166233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2551  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  47.17 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2176  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1632  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  42.11 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  43.4 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  44.19 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0755  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0755  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.996162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1697  ribosomal protein S21  60.34 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.674654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0314  ribosomal protein S21  35.85 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555327 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2616  30S ribosomal protein S21  40.38 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000160878  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  51.16 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 58 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  35.09 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 58 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2430  30S ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 57 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  41.51 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0246  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1020  30S ribosomal protein S21  43.75 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5375  ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.55538 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5595  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  37.74 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5959  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  41.3 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  41.3 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5802  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5585  30S ribosomal protein S21  43.48 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  41.3 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6460  30S ribosomal protein S21  45.65 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  36.96 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  35.85 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1122  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00364781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  36.96 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3215  ribosomal protein S21  41.3 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603816  hitchhiker  0.00000000377258 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  39.58 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  39.58 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  39.58 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0896  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.82181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  35.85 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0389  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1947  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1856  30S ribosomal protein S21  36.07 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1303  30S ribosomal protein S21  37.74 
 
 		 61 aa  43.5  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000518978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  34.78 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0984  30S ribosomal protein S21  39.62 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2369  ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.688935  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0728  30S ribosomal protein S21  40.43 
 
 		 63 aa  42.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000434468  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  37.74 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  41.3 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2473  30S ribosomal protein S21  37.21 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000983176  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3830  30S ribosomal protein S21  39.13 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2987  30S ribosomal protein S21  39.13 
 
 		 70 aa  42  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2056  30S ribosomal protein S21  48.72 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.908846  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1001  30S ribosomal protein S21  34.43 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2461  ribosomal protein S21  35.9 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0201196  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0105  30S ribosomal protein S21  39.13 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.759736  normal  0.539683 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0630  ribosomal protein S21  42.86 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.134333  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  35.19 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  36.96 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2872  30S ribosomal protein S21  42.55 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0089  30S ribosomal protein S21  42.55 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3344  30S ribosomal protein S21  42.55 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  34.62 
 
 		 70 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3195  30S ribosomal protein S21  42.55 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  39.13 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2865  30S ribosomal protein S21  42.55 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631182  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  38.1 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0157  30S ribosomal protein S21  42.55 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0242  30S ribosomal protein S21  42.55 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0660  30S ribosomal protein S21  40.48 
 
 		 71 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186503  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3447  30S ribosomal protein S21  42.55 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.138674  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1672  30S ribosomal protein S21  42.55 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0170  30S ribosomal protein S21  42.55 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3103  30S ribosomal protein S21  42.55 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0811992  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0152  30S ribosomal protein S21  42.55 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926956 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0224  30S ribosomal protein S21  42.55 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1143  30S ribosomal protein S21  33.96 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.797768  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3780  30S ribosomal protein S21  39.13 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792875  normal  0.0326962 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0797  ribosomal protein S21  38.98 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.914511  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3254  30S ribosomal protein S21  39.13 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0163212 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1633  30S ribosomal protein S21  33.96 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>