111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0599 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  652    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  91.34 
 
 
401 aa  610  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  97.49 
 
 
384 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  92.83 
 
 
330 aa  526  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  80.29 
 
 
299 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2294  hypothetical protein  81.15 
 
 
276 aa  429  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  65.62 
 
 
334 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  66.67 
 
 
334 aa  363  3e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  67.65 
 
 
320 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  63.38 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  64.52 
 
 
201 aa  85.9  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0624  hypothetical protein  51.19 
 
 
130 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0436757  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  69.12 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  67.14 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  62.07 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  64.81 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  46.34 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  26.12 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  26.05 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  26.26 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  25.37 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  50.72 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  27.27 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  29.15 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  25.28 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  51.47 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  59.26 
 
 
211 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  28.52 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  24.47 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  24.44 
 
 
292 aa  67  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  24.54 
 
 
282 aa  67  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  24.47 
 
 
296 aa  67  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  49.33 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  25.5 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  24.09 
 
 
293 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  28 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  27.02 
 
 
311 aa  63.9  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  22.92 
 
 
315 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  25.71 
 
 
308 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  54.29 
 
 
322 aa  62.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  25.96 
 
 
326 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  27.6 
 
 
310 aa  62.4  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  23.81 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  26.46 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  24.3 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  43.66 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  26.45 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  24.48 
 
 
327 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  26.8 
 
 
325 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  24.3 
 
 
284 aa  59.7  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  39.74 
 
 
339 aa  59.7  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  25.44 
 
 
313 aa  59.7  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  46.38 
 
 
330 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  40 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  41.46 
 
 
343 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  56.25 
 
 
350 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  24.41 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  22.36 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  52.94 
 
 
314 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  28.81 
 
 
315 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  25.46 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  23.82 
 
 
325 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  23.56 
 
 
331 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  29.66 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  42.42 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  22.6 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  45.71 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  25 
 
 
296 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  46.67 
 
 
323 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  43.28 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  29.31 
 
 
319 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  40 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  44.29 
 
 
335 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  39.71 
 
 
319 aa  52.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  42.42 
 
 
329 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  26.59 
 
 
314 aa  52.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  36.07 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  26.8 
 
 
288 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  41.27 
 
 
333 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  43.28 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  23.88 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  43.28 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  27.81 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  25.72 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  26.98 
 
 
307 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  26.98 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  26.98 
 
 
307 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  25.91 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  25.32 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  38.81 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  22.39 
 
 
326 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  23.7 
 
 
288 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  24.19 
 
 
298 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  24.24 
 
 
233 aa  47.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  23.26 
 
 
311 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  43.48 
 
 
166 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  20.75 
 
 
313 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0248  hypothetical cytosolic protein  38.24 
 
 
138 aa  46.2  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1946  hypothetical protein  38.24 
 
 
138 aa  46.2  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000308535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>