91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2183 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  658    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  92.59 
 
 
324 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  91.25 
 
 
320 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  76.19 
 
 
336 aa  526  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  69.75 
 
 
235 aa  351  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  84.24 
 
 
206 aa  346  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  82.44 
 
 
201 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  48.49 
 
 
339 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  53.42 
 
 
316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  53.71 
 
 
324 aa  317  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  55.3 
 
 
321 aa  311  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  56.92 
 
 
317 aa  311  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  53.01 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  49.31 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  53.61 
 
 
316 aa  301  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  66.97 
 
 
211 aa  301  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  52.77 
 
 
324 aa  291  8e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  51.59 
 
 
312 aa  291  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  54.89 
 
 
252 aa  273  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  50.95 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  44.44 
 
 
311 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  44.37 
 
 
334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  41.61 
 
 
310 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  43.28 
 
 
319 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  43.28 
 
 
319 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  41.25 
 
 
311 aa  229  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  40.21 
 
 
327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  41.8 
 
 
313 aa  225  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  44.66 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  35.91 
 
 
325 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  43.48 
 
 
307 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  36.18 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  35.6 
 
 
325 aa  212  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  37.79 
 
 
312 aa  212  7e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  36 
 
 
335 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  35.21 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  31.79 
 
 
317 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  29.43 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  31.89 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  28.48 
 
 
304 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  31.19 
 
 
302 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  28.39 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  28.84 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  25.48 
 
 
313 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  31.03 
 
 
297 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  25.24 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  26.63 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  28.82 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0624  hypothetical protein  58.75 
 
 
130 aa  86.7  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0436757  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  69.12 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  27.88 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  27.44 
 
 
311 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  30.09 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  29.77 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  29.62 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1946  hypothetical protein  38.89 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000308535  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0248  hypothetical cytosolic protein  38.89 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  27.65 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  29.43 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  27.65 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  28.37 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  66.67 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  64.18 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  28.57 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  28.83 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  28.57 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0748  hypothetical protein  32.52 
 
 
134 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000803284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  28.94 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  34.38 
 
 
337 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  27.72 
 
 
310 aa  62.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  46.97 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  27.97 
 
 
322 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  46.88 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  32.58 
 
 
343 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  56.25 
 
 
350 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  42.86 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  51.52 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  30.11 
 
 
333 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  33.72 
 
 
330 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  30.34 
 
 
329 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  32.56 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1707  hypothetical protein  27.43 
 
 
280 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.420351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  31.82 
 
 
329 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  33.33 
 
 
335 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1243  hypothetical protein  26.87 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1063  hypothetical protein  43.08 
 
 
82 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000299029  normal  0.0436362 
 
 
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  29.07 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1247  hypothetical protein  23.23 
 
 
336 aa  46.6  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  29.45 
 
 
166 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1249  hypothetical protein  28.68 
 
 
154 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  23.49 
 
 
318 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>