110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0564 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  61.31 
 
 
317 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  60.06 
 
 
325 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  51.67 
 
 
304 aa  323  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  55.92 
 
 
297 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  55.14 
 
 
283 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  54.92 
 
 
292 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  44.44 
 
 
315 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  52.63 
 
 
284 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  54.92 
 
 
301 aa  254  9e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  50.91 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  48.48 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  47.95 
 
 
340 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  40.58 
 
 
317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  40.79 
 
 
313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  48.29 
 
 
304 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  39.87 
 
 
311 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1707  hypothetical protein  55.07 
 
 
280 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.420351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  32.26 
 
 
318 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  31.06 
 
 
330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0748  hypothetical protein  61.16 
 
 
134 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000803284  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0749  hypothetical protein  46.67 
 
 
122 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000564338  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  30.72 
 
 
320 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  31.03 
 
 
324 aa  106  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  26.38 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  29.81 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  28.77 
 
 
311 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  31.51 
 
 
320 aa  95.5  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1249  hypothetical protein  35.62 
 
 
154 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  29.14 
 
 
334 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  27.37 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  27.33 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  23.4 
 
 
339 aa  87  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  32.28 
 
 
166 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  28.36 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  29.12 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  29.41 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  26.13 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  24.77 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  24.77 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3228  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000432911  normal  0.0886646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  27.52 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  28.68 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  33.79 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  26.55 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  31.58 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  27.52 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  27.8 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  26.42 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  27.68 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  26.51 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  27.24 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  31.09 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  30.57 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  23.15 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  27.12 
 
 
252 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3564  hypothetical protein  37.36 
 
 
94 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0951658  normal  0.295077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  25.16 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1818  hypothetical protein  25.25 
 
 
280 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.937622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  24.92 
 
 
314 aa  59.3  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  44.44 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  24.31 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4879  hypothetical protein  24.86 
 
 
196 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3060  hypothetical protein  24.27 
 
 
280 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1128  hypothetical protein  25.37 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  25.08 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1515  hypothetical protein  25.51 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3365  hypothetical protein  41.38 
 
 
61 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222759  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1542  hypothetical protein  25.51 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.966764  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2808  hypothetical protein  35.06 
 
 
85 aa  52.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1243  hypothetical protein  34.62 
 
 
288 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  25.33 
 
 
235 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4873  hypothetical protein  39.68 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  34.69 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2630  hypothetical protein  23.87 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0149  hypothetical protein  24.92 
 
 
298 aa  50.1  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00561727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  21.93 
 
 
331 aa  49.7  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  21.5 
 
 
319 aa  49.7  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1883  hypothetical protein  46.51 
 
 
80 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  24.15 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4509  hypothetical protein  35.94 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  22.01 
 
 
312 aa  47  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0807  hypothetical protein  37.5 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  37.5 
 
 
326 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  36.92 
 
 
303 aa  45.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2072  hypothetical protein  22.62 
 
 
306 aa  45.8  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.166176 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3597  hypothetical protein  54.05 
 
 
58 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2074  hypothetical protein  21.43 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  22.22 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0248  hypothetical cytosolic protein  35.59 
 
 
138 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1946  hypothetical protein  35.59 
 
 
138 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000308535  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1572  hypothetical protein  25.33 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5391  hypothetical protein  36.62 
 
 
70 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.566383  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  37.5 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  37.5 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1000  hypothetical protein  34.67 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5118  hypothetical protein  24.38 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>