57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1962 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  45.82 
 
 
311 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  42.5 
 
 
313 aa  275  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  43.48 
 
 
311 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  42.62 
 
 
334 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  40.81 
 
 
310 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  42.24 
 
 
307 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  43.88 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  44.96 
 
 
324 aa  228  8e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  36.09 
 
 
339 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  44.91 
 
 
321 aa  227  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  41.22 
 
 
319 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  41.22 
 
 
319 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  36.91 
 
 
320 aa  226  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  43.12 
 
 
320 aa  224  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  41.13 
 
 
320 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  35.96 
 
 
324 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  41.1 
 
 
324 aa  216  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  43.08 
 
 
316 aa  216  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  43.02 
 
 
317 aa  212  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  40.73 
 
 
312 aa  209  6e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  39.32 
 
 
311 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  38.43 
 
 
336 aa  206  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  41.67 
 
 
341 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  40.74 
 
 
324 aa  202  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  36.22 
 
 
335 aa  202  5e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  38.25 
 
 
325 aa  202  6e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  43.64 
 
 
252 aa  200  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  37.89 
 
 
325 aa  199  6e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  36.95 
 
 
312 aa  199  7e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  41.31 
 
 
310 aa  196  6e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  38.37 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  30.14 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  36.05 
 
 
201 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  37.25 
 
 
211 aa  106  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  34.27 
 
 
206 aa  99.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  25.09 
 
 
317 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  27.6 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  24 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  25.61 
 
 
317 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  23.26 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  23.58 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  23.38 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  24.75 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  25.55 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  26.32 
 
 
302 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  22.82 
 
 
297 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  25.32 
 
 
311 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  22.99 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  25.09 
 
 
304 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  22.95 
 
 
290 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  24.54 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  22.44 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  22.93 
 
 
284 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  23.84 
 
 
300 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0748  hypothetical protein  29.73 
 
 
134 aa  46.2  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000803284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  23.69 
 
 
283 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>