204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2623 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  657    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  98.76 
 
 
318 aa  643    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  96.27 
 
 
314 aa  625  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  97.83 
 
 
322 aa  624  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  96.27 
 
 
314 aa  608  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  77.95 
 
 
310 aa  521  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  31.96 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  32.05 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  30.27 
 
 
317 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  34.77 
 
 
339 aa  139  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  32.35 
 
 
323 aa  135  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  29.97 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  28.72 
 
 
331 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  31.16 
 
 
329 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  30.75 
 
 
343 aa  132  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  29.7 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  29.08 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  30.36 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  30.3 
 
 
321 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  28.62 
 
 
323 aa  125  9e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  30.98 
 
 
330 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  30.1 
 
 
312 aa  122  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1121  hypothetical protein  27.83 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  28.52 
 
 
327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  28.57 
 
 
331 aa  116  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  29.97 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1606  hypothetical protein  28.66 
 
 
307 aa  113  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  30.34 
 
 
310 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  30 
 
 
313 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  29.45 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  30.49 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  27.5 
 
 
319 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  29.72 
 
 
304 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  29.5 
 
 
304 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  29.5 
 
 
304 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  27.8 
 
 
316 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  29.5 
 
 
304 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  28.53 
 
 
320 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  29.45 
 
 
334 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  29.04 
 
 
296 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  29.04 
 
 
296 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  29.04 
 
 
296 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1000  hypothetical protein  28.79 
 
 
307 aa  106  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  29.6 
 
 
319 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  29.04 
 
 
296 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  29.55 
 
 
308 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  29.04 
 
 
296 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  28.68 
 
 
296 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0409  hypothetical protein  27.08 
 
 
336 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.650641  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2153  hypothetical protein  26.96 
 
 
332 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.101261 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  28.87 
 
 
317 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  28.87 
 
 
317 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0740  hypothetical protein  24.64 
 
 
323 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.559811  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0238  hypothetical protein  25.44 
 
 
344 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.447255  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  29.18 
 
 
321 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  29.89 
 
 
292 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  30.6 
 
 
319 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  34.66 
 
 
292 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  30.6 
 
 
319 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  30.6 
 
 
319 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  29.89 
 
 
292 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4059  putative transposase  26.79 
 
 
332 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0643  hypothetical protein  30.08 
 
 
247 aa  99.8  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.460705  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  28.39 
 
 
307 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  26.6 
 
 
318 aa  99.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  29.74 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  30.3 
 
 
292 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  29.62 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4072  putative transposase  26.95 
 
 
340 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  34.29 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  29.62 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  33.52 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  29.62 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  28.11 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  29.62 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  28.11 
 
 
311 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  28 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  28 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  30.34 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4014  putative transposase  26.79 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.456112  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  30.42 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  30.42 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  34.43 
 
 
255 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  29.41 
 
 
299 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4028  putative transposase  26.6 
 
 
340 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  34.15 
 
 
341 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  29.23 
 
 
292 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  33.88 
 
 
314 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  30 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  42.28 
 
 
141 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  30 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  30 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  27.4 
 
 
311 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1247  hypothetical protein  25.41 
 
 
336 aa  94  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  28.41 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  29.64 
 
 
310 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  33.33 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  26.44 
 
 
296 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  26.87 
 
 
313 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  25.83 
 
 
309 aa  89.4  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>