71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1410 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  483  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  88.83 
 
 
211 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  68.11 
 
 
336 aa  348  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  68.49 
 
 
320 aa  340  8e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  66.8 
 
 
320 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  66.53 
 
 
324 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  70.26 
 
 
206 aa  290  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  65.17 
 
 
201 aa  278  6e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  39.61 
 
 
339 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  50.88 
 
 
316 aa  189  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  40.64 
 
 
310 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  50.29 
 
 
324 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  49.12 
 
 
324 aa  185  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  50.29 
 
 
321 aa  185  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  52.63 
 
 
317 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  47.95 
 
 
320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  48.54 
 
 
316 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  44.66 
 
 
324 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  47.13 
 
 
252 aa  164  9e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  48.26 
 
 
312 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  41.55 
 
 
311 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  43.27 
 
 
334 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  37.9 
 
 
311 aa  149  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  43.22 
 
 
310 aa  148  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  38.1 
 
 
307 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  31.82 
 
 
325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  34.5 
 
 
312 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  34.08 
 
 
319 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  34.08 
 
 
319 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  36.32 
 
 
311 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  31.4 
 
 
325 aa  135  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  36.45 
 
 
313 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  31.27 
 
 
341 aa  131  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  38.37 
 
 
327 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  31.4 
 
 
335 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  31.37 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  32.37 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0624  hypothetical protein  45.12 
 
 
130 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0436757  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  64.81 
 
 
319 aa  60.1  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  24.89 
 
 
318 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  64.81 
 
 
401 aa  58.9  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  64.81 
 
 
384 aa  58.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  27.59 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  49.09 
 
 
314 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1946  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  53.1  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000308535  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0248  hypothetical cytosolic protein  33.33 
 
 
138 aa  53.1  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  49.09 
 
 
318 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  49.09 
 
 
322 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  24.4 
 
 
330 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  47.92 
 
 
350 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  47.46 
 
 
343 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  28.57 
 
 
284 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  40 
 
 
310 aa  48.9  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  25.33 
 
 
304 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  27.68 
 
 
292 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  30.34 
 
 
329 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  25.97 
 
 
302 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  50.91 
 
 
339 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  45.83 
 
 
331 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  34 
 
 
319 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  30.86 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  41.67 
 
 
321 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  29.21 
 
 
329 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  36.51 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  33.33 
 
 
333 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  27.43 
 
 
283 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  50.91 
 
 
322 aa  42.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1249  hypothetical protein  39.44 
 
 
154 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  50.91 
 
 
314 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  36.36 
 
 
345 aa  42  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  37.5 
 
 
321 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>