152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0878 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  100 
 
 
321 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  90.27 
 
 
329 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  95.02 
 
 
321 aa  578  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  87.83 
 
 
337 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  93.91 
 
 
330 aa  555  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  87.69 
 
 
333 aa  548  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  89.36 
 
 
329 aa  548  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  80 
 
 
345 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  76.88 
 
 
335 aa  512  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2828  putative transposase  52.47 
 
 
338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.949777  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  41.49 
 
 
323 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  31.6 
 
 
318 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  31.13 
 
 
310 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  30.3 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  31 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  31.91 
 
 
314 aa  129  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  30 
 
 
322 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  27.81 
 
 
331 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  33.57 
 
 
311 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0691  putative transposase  89.23 
 
 
67 aa  119  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  26.5 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  27.49 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  26.59 
 
 
343 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2830  hypothetical protein  84.06 
 
 
85 aa  116  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.362282  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  33.57 
 
 
311 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  33.22 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  32.98 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  29.33 
 
 
317 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  36.5 
 
 
308 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  28.47 
 
 
341 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  26.5 
 
 
327 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  26.78 
 
 
339 aa  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2307  hypothetical protein  29.8 
 
 
321 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000450312  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  28.62 
 
 
298 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  28.62 
 
 
298 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  29.58 
 
 
300 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  29.23 
 
 
300 aa  99  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  29.23 
 
 
300 aa  99  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  29.23 
 
 
300 aa  99  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  29.23 
 
 
300 aa  99  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  31.25 
 
 
331 aa  99  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2289  hypothetical protein  33.85 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0492229  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  29.85 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  29.79 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  28.16 
 
 
306 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  30.35 
 
 
334 aa  95.9  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  30.03 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  24.23 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  28.99 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  30.89 
 
 
314 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  29.15 
 
 
298 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  32.14 
 
 
255 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0658  putative transposase  29.61 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193277 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1702  hypothetical protein  29.47 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  30.12 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  30.07 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  29.1 
 
 
309 aa  90.9  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  30.07 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  30.07 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  29.26 
 
 
296 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  30.81 
 
 
350 aa  90.5  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2267  hypothetical protein  30.29 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  29.26 
 
 
296 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  28.89 
 
 
296 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  28.89 
 
 
296 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  28.89 
 
 
296 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  29.14 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4059  putative transposase  29.13 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4072  putative transposase  29.13 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  33.61 
 
 
141 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  28.47 
 
 
299 aa  87  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0238  hypothetical protein  27.96 
 
 
344 aa  86.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.447255  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  28.72 
 
 
308 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  28.63 
 
 
292 aa  86.7  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  27.12 
 
 
288 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4014  putative transposase  29.13 
 
 
332 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.456112  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  29.73 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  28.63 
 
 
292 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4028  putative transposase  29.13 
 
 
340 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  28.47 
 
 
300 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1247  hypothetical protein  22.22 
 
 
336 aa  85.9  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  28.32 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  28.32 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  28.21 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  34.02 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  28.24 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  28.12 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  28.24 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  25.68 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  28.24 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  28.24 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  29.34 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  28.31 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  28.31 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  28.21 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  28.24 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  28.31 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  27.71 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0740  hypothetical protein  25.38 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.559811  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  28.19 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>