90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1257 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  665    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  92.59 
 
 		 320 aa  594  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  89.2 
 
 		 320 aa  592  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  79.46 
 
 		 336 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  82.69 
 
 		 206 aa  348  1e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  81.82 
 
 		 201 aa  346  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  49.4 
 
 		 339 aa  342  7e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  66.53 
 
 		 235 aa  335  5e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  52.65 
 
 		 324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  54.72 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  53.41 
 
 		 317 aa  305  8.000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  48.98 
 
 		 321 aa  305  9.000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  51.09 
 
 		 316 aa  298  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  66.06 
 
 		 211 aa  297  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  50.18 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  49.64 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  51.79 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  49.31 
 
 		 324 aa  285  8e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  49.28 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  52.77 
 
 		 252 aa  263  3e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  43.38 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  41.98 
 
 		 311 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  40.13 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  43.37 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  43.37 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  42.17 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  40.39 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  35.96 
 
 		 327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  44.27 
 
 		 311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  36.84 
 
 		 325 aa  222  6e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  38.91 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  42.16 
 
 		 307 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  36.53 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  35.29 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  35.08 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  34.27 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  30.36 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  32.53 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  30.96 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  29.97 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  31.43 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  29.05 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  29.85 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  31.83 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  26.11 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0624  hypothetical protein  57.5 
 
 		 130 aa  93.6  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0436757  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  27.22 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  25.8 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  28.48 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  28.25 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  28.57 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  27.43 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  56.63 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  65.71 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  29.72 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  29.92 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  30.36 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  53.01 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  27.94 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  30.43 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  29.86 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  28.57 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  28.57 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  48.68 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0248  hypothetical cytosolic protein  37.5 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1946  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000308535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  33.33 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  34.38 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  25.08 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  29.69 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  42.86 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  26.9 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0748  hypothetical protein  31.97 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000803284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  50 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  56.25 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  38.46 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  41.79 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  47.54 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  32.26 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  37.65 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  31.51 
 
 		 166 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  44.07 
 
 		 329 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  41.79 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1707  hypothetical protein  27.59 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.420351  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1247  hypothetical protein  22.54 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1249  hypothetical protein  29.29 
 
 		 154 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  40 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  38.81 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  25.37 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1128  hypothetical protein  31.43 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>