100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1248 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  690    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  79.46 
 
 		 324 aa  558  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  77.08 
 
 		 320 aa  534  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  78.27 
 
 		 320 aa  524  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  70.08 
 
 		 235 aa  362  4e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  48.8 
 
 		 339 aa  344  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  54.2 
 
 		 316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  52.8 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  51.02 
 
 		 321 aa  320  3e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  52.28 
 
 		 317 aa  318  9e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  69.1 
 
 		 211 aa  315  7e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  69.23 
 
 		 201 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  69.55 
 
 		 206 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  50.68 
 
 		 324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  48.96 
 
 		 316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  48.98 
 
 		 320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  49.65 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  49.65 
 
 		 312 aa  291  7e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  49.63 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  52.77 
 
 		 252 aa  267  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  43.77 
 
 		 334 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  39.88 
 
 		 311 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  36.81 
 
 		 310 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  44.9 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  44.9 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  42.58 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  42.65 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  43.48 
 
 		 307 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  36.86 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  38.24 
 
 		 311 aa  219  7e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  36.56 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  37.65 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  37.54 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  38.43 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  36.22 
 
 		 312 aa  202  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  31.87 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  34.42 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  31.1 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  29.79 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  29.53 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  70.24 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  29.61 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  27.03 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0624  hypothetical protein  53.26 
 
 		 130 aa  90.5  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0436757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  28.02 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  28.77 
 
 		 345 aa  85.9  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  27.34 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  28 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  23.85 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  25.61 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  23.85 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  67.14 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  29.51 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  59.7 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  58.21 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  41.12 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  66.67 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  28.22 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  44.66 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  27.87 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  28.46 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0248  hypothetical cytosolic protein  36.29 
 
 		 138 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  27.59 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1946  hypothetical protein  36.29 
 
 		 138 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000308535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  24.9 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0748  hypothetical protein  31.15 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000803284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  27.5 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  59.7 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  47.5 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  45.78 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  27.37 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  33.63 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  27.84 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5118  hypothetical protein  25.98 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  44.07 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  41.43 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  27.85 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  52.08 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  59.52 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  22.73 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  38.57 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  38.89 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  33.98 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  39.34 
 
 		 321 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  40 
 
 		 329 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3181  hypothetical protein  33.87 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.913856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  24.16 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  28.62 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  36.11 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4873  hypothetical protein  40.45 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  40 
 
 		 329 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  27.5 
 
 		 306 aa  46.2  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2677  hypothetical protein  36.84 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1249  hypothetical protein  42.59 
 
 		 154 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0361  hypothetical protein  31.01 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0354  hypothetical protein  31.01 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  28.99 
 
 		 312 aa  43.5  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0539  hypothetical protein  42.5 
 
 		 277 aa  43.1  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0238  hypothetical protein  34.69 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.447255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3289  hypothetical protein  46 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00577897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>