239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1504 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  100 
 
 
350 aa  696    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  54.76 
 
 
343 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  54.76 
 
 
339 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  53.03 
 
 
331 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  51.01 
 
 
319 aa  361  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1702  hypothetical protein  56.6 
 
 
326 aa  334  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412934  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1400  putative transposase  41.82 
 
 
301 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429556  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1399  putative transposase  41.95 
 
 
293 aa  205  8e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1398  putative transposase  42.21 
 
 
289 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1411  hypothetical protein  42.75 
 
 
312 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.27197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4072  putative transposase  34.74 
 
 
340 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4028  putative transposase  34.74 
 
 
340 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4059  putative transposase  32.29 
 
 
332 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4014  putative transposase  32.29 
 
 
332 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.456112  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0409  hypothetical protein  31.92 
 
 
336 aa  142  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.650641  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0238  hypothetical protein  33.44 
 
 
344 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.447255  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2153  hypothetical protein  31.92 
 
 
332 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.101261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0658  putative transposase  31.03 
 
 
332 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193277 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2267  hypothetical protein  31.16 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2307  hypothetical protein  29.81 
 
 
321 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000450312  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  29.01 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0740  hypothetical protein  27.85 
 
 
323 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.559811  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2289  hypothetical protein  28.62 
 
 
333 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0492229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  27.56 
 
 
329 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  27.61 
 
 
337 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  28.03 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  26.7 
 
 
335 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  27.46 
 
 
318 aa  109  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  27.48 
 
 
333 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  27.25 
 
 
310 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  27.37 
 
 
329 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  26.59 
 
 
314 aa  106  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  28.32 
 
 
322 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  27.07 
 
 
321 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  26.78 
 
 
321 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  27.38 
 
 
330 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  30.03 
 
 
318 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2285  hypothetical protein  28.57 
 
 
288 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  23.12 
 
 
331 aa  99  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  28.29 
 
 
323 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  30.13 
 
 
339 aa  96.3  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  27.17 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  28.94 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  26.48 
 
 
304 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  27.46 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2256  hypothetical protein  24.09 
 
 
315 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000395592  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1247  hypothetical protein  24.3 
 
 
336 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  27.18 
 
 
308 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  27.27 
 
 
316 aa  90.1  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  27.33 
 
 
288 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  26.13 
 
 
304 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  26.13 
 
 
304 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0367  hypothetical protein  27.48 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000913589  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  26.13 
 
 
304 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  25.41 
 
 
321 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  25.26 
 
 
308 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  25.33 
 
 
311 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1309  hypothetical protein  27.64 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  25.99 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2294  hypothetical protein  27.68 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  25.33 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  25.23 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2630  hypothetical protein  25.55 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  25.23 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  24.39 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  36.67 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  36.67 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  36.67 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  36.67 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  36.67 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  21.71 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  25 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  35.83 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  36.67 
 
 
292 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  35.83 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2673  hypothetical protein  27.48 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000356994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  35.83 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1121  hypothetical protein  21.37 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2474  hypothetical protein  28.38 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000139417  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  27.06 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  33.06 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  33.06 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  33.06 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  33.06 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  33.06 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  33.06 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  27.56 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  25.24 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  27.56 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  26.42 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  35.77 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  33.06 
 
 
313 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  33.06 
 
 
313 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  33.06 
 
 
313 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  33.33 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  27.4 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  26.52 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  37.19 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  37.19 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  37.19 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>